More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0029 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  57.14 
 
 		 210 aa  228  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  51.9 
 
 		 215 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  50.95 
 
 		 215 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.06 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.54 
 
 		 210 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  46.41 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  46.89 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  43.06 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.06 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  39.61 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.14 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.61 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  42.18 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.65 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  42.25 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.65 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  38.65 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.48 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  37.98 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 206 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.8 
 
 		 204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  40.65 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.26 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  36.79 
 
 		 186 aa  134  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.67 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  38.03 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  33.65 
 
 		 204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  36.18 
 
 		 209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  33.17 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.53 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  38.03 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  33.33 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  32.39 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 205 aa  114  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  33.98 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 230 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.51 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.79 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.75 
 
 		 202 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 237 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  32.23 
 
 		 203 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  29.19 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  31.43 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  30.58 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  30.81 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  42.11 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  32.04 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  35.2 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  30.37 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.16 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  35.2 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  29.81 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  40.2 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0981  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  25.7 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3320  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000262213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.88 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.66 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  24.51 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  30.65 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2420  glutathione S-transferase-like  27.01 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.608511  normal  0.0917886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  42.31 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  41.94 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  32.71 
 
 		 260 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  32.14 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.71 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  27.44 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  42.86 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  43.01 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2272  maleylacetoacetate isomerase  41.49 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0111358  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  40.21 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  41.94 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  39.36 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.71 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  28.3 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  28.84 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.24 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  37.36 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  49.32 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  43.53 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  25.84 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>