More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3821 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.59 
 
 
202 aa  185  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
202 aa  167  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  37.14 
 
 
203 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  34.39 
 
 
210 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  33.86 
 
 
210 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  34.9 
 
 
212 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  33.86 
 
 
210 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 
203 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 
208 aa  98.2  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
208 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  32.23 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  30.54 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  31.03 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
210 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  31.43 
 
 
210 aa  95.5  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.19 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 
208 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  31.58 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  31.02 
 
 
186 aa  93.6  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  35.08 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  31.73 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  35.08 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  31.75 
 
 
215 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  30.62 
 
 
215 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  32.35 
 
 
206 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  31.77 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  25.37 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.7 
 
 
219 aa  85.1  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  32.11 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  34.63 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  28.08 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
205 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  30.73 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 
205 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  30.73 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  31.22 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.25 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  31.47 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  31.41 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  32.77 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  34.41 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  29.61 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.47 
 
 
215 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  26.37 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  31.89 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  30.1 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  31.64 
 
 
210 aa  77.8  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  29.33 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1381  Glutathione S-transferase domain protein  26.9 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0785607  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  29.13 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  30.64 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  32.46 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.85 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.9 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  35.19 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.88 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2272  maleylacetoacetate isomerase  31.88 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0111358  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  29.41 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.32 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  29.48 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  29.9 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  28.64 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  31.82 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  28.64 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.69 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  28.64 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  30 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  31.46 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  29.21 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  28.29 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  29.74 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  31.37 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  30.65 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  29.06 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2104  putative glutathione S-transferase  29.06 
 
 
198 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  27.95 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  32.4 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  29.78 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  26.87 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  29.47 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  28.57 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  27.59 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  27.94 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  26.11 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>