More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3554 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  69.34 
 
 		 212 aa  300  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  66.67 
 
 		 212 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  67.62 
 
 		 212 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  69.05 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  69.05 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  68.57 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  67.62 
 
 		 210 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  62.2 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1191  maleylacetoacetate isomerase  61.24 
 
 		 211 aa  228  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916605  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  57.62 
 
 		 212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  54.93 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  48.79 
 
 		 215 aa  203  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 		 215 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  49.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 212 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  45.58 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  48.61 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 229 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  48.36 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 217 aa  181  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  46.15 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  44.91 
 
 		 215 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  46.92 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  46.73 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 216 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  43.89 
 
 		 221 aa  177  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  49.05 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  43.46 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  40.55 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  45.54 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  46.33 
 
 		 221 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  49.75 
 
 		 200 aa  174  9e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  47.6 
 
 		 219 aa  173  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  43.19 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  40.48 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  47.17 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  44.7 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  45.12 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  44.5 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  45.75 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  43.63 
 
 		 210 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  44.86 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 216 aa  167  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  43.24 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  45.59 
 
 		 210 aa  167  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  46.07 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  44.02 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  43.66 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  43.19 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  44.34 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  44.13 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  42.53 
 
 		 222 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  44.95 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  42.25 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  44.95 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  46.48 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.63 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  44.12 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  41.78 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  44.95 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  44.81 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  44.44 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>