More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3147 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  81.13 
 
 		 212 aa  352  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  72.77 
 
 		 213 aa  307  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  68.4 
 
 		 212 aa  304  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  63.03 
 
 		 215 aa  280  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  58.77 
 
 		 214 aa  261  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  55.45 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  54.21 
 
 		 215 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  52.58 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 		 214 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 		 215 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 214 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  48.58 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  48.82 
 
 		 216 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 		 214 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  50.95 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  47.37 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  46.92 
 
 		 212 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  48.57 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  49.76 
 
 		 217 aa  199  3.9999999999999996e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  45.37 
 
 		 217 aa  197  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  51.9 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  49.08 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  49.08 
 
 		 216 aa  194  7e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  48.62 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  48.62 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  47.39 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  49.08 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  48.62 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  48.87 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  45.28 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  48.17 
 
 		 216 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  46.77 
 
 		 216 aa  188  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 		 219 aa  187  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  47.25 
 
 		 216 aa  187  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  48.4 
 
 		 222 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  45.74 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  45.21 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  44.71 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  47.39 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  46.88 
 
 		 214 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  47.27 
 
 		 221 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  48.39 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  43.84 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  47.4 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  45.5 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  48.15 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  47.4 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  46.33 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  45.97 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 		 220 aa  178  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  46.33 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  44.55 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  45.71 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  43.69 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  42.79 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  46.36 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  46.92 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  46.08 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1191  maleylacetoacetate isomerase  51.63 
 
 		 211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 		 213 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  44.83 
 
 		 210 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  44.65 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  44.55 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  42.47 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3583  maleylacetoacetate isomerase  43.6 
 
 		 217 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>