More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2870 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  99.53 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  92.06 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  90.65 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  90.65 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  90.65 
 
 		 214 aa  413  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  90.65 
 
 		 214 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  77.57 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  77.57 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  77.57 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  76.17 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  77.57 
 
 		 214 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  75.7 
 
 		 214 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  78.39 
 
 		 214 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  77.39 
 
 		 214 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  77.89 
 
 		 214 aa  331  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  71.96 
 
 		 214 aa  331  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  77.39 
 
 		 214 aa  329  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  67.44 
 
 		 215 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  65.89 
 
 		 215 aa  299  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  68.22 
 
 		 214 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  62.44 
 
 		 214 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  61.97 
 
 		 216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  61.21 
 
 		 214 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  61.08 
 
 		 216 aa  267  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  60.09 
 
 		 216 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  60.09 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  60.09 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  59.17 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  59.17 
 
 		 216 aa  255  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  57.94 
 
 		 213 aa  254  7e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  58.72 
 
 		 216 aa  252  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  58.26 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  57.6 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  56.88 
 
 		 216 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  55.14 
 
 		 213 aa  243  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  53.52 
 
 		 222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  55.14 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  53.46 
 
 		 216 aa  241  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  52.04 
 
 		 221 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  53.95 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  53.46 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 		 216 aa  238  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  53.08 
 
 		 215 aa  238  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  52.27 
 
 		 220 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  52.53 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 212 aa  234  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  52.56 
 
 		 213 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  51.61 
 
 		 216 aa  228  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  54.05 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  57.08 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  54.42 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  51.16 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  53.27 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 215 aa  225  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  57.55 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  52.47 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  52.02 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 		 230 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  52.02 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  48.79 
 
 		 212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  51.12 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  47.83 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  53.77 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  55.19 
 
 		 218 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 		 213 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 		 212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 		 216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  52.83 
 
 		 213 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 215 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  51.42 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  51.42 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  48.36 
 
 		 214 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  52.58 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 213 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  47.22 
 
 		 222 aa  208  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  47.69 
 
 		 222 aa  207  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  49.5 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 212 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0920  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 217 aa  202  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  52.11 
 
 		 217 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 213 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  50.23 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  48.36 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 214 aa  191  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 213 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 213 aa  190  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>