More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3762 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  59.72 
 
 		 216 aa  269  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  59.72 
 
 		 216 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  59.26 
 
 		 216 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  56.16 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  58.33 
 
 		 216 aa  264  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  59.35 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  58.22 
 
 		 214 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  57.41 
 
 		 216 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  57.41 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  57.41 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  56.94 
 
 		 216 aa  257  8e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  55.5 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  55.35 
 
 		 216 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  56.74 
 
 		 216 aa  254  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  54.07 
 
 		 215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  55.35 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  55.87 
 
 		 213 aa  248  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  55.09 
 
 		 222 aa  244  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  54.88 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  51.87 
 
 		 214 aa  239  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  52.78 
 
 		 222 aa  234  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  51.39 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 		 222 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  51.4 
 
 		 214 aa  227  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 214 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  49.3 
 
 		 230 aa  214  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  49.05 
 
 		 215 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  48.96 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  48.96 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  48.96 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 213 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 215 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  47.42 
 
 		 216 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  49.52 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  48.56 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  50.25 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  45.54 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  46.53 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  48.11 
 
 		 214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  47.64 
 
 		 214 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  47.17 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  45.09 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  43.19 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  43.6 
 
 		 213 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 213 aa  191  8e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0920  maleylacetoacetate isomerase  48.1 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  43.4 
 
 		 213 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  43.13 
 
 		 213 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  43.81 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  45.33 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 213 aa  185  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  42.18 
 
 		 213 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  43.87 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  44.34 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.66 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 212 aa  181  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  42.99 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  43.4 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  43.44 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  40.57 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  41.98 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  42.6 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  42.79 
 
 		 222 aa  175  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  40.28 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  46.94 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  43.87 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  41.51 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  42.4 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  39.34 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>