More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2019 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 213 aa  443  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  74.06 
 
 		 212 aa  342  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  73.58 
 
 		 216 aa  338  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  65.77 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  65.77 
 
 		 222 aa  294  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  63.64 
 
 		 222 aa  284  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  62.9 
 
 		 221 aa  280  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  63.68 
 
 		 213 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  61.26 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  61.32 
 
 		 213 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  57.01 
 
 		 214 aa  261  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  60 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  58.6 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  57.35 
 
 		 214 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  56.87 
 
 		 216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  56.07 
 
 		 214 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  57.48 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  57.48 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  57.48 
 
 		 214 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  56.54 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  57.01 
 
 		 214 aa  247  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  55.14 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  55.14 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  54.67 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  54.67 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  54.67 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  54.67 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  54.67 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  57.92 
 
 		 216 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  54.21 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  57.21 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  55.28 
 
 		 214 aa  227  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  51.85 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  54.77 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  55.28 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  55.28 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 216 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 216 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  51.85 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  52.38 
 
 		 213 aa  224  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  51.58 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  51.61 
 
 		 216 aa  224  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  51.9 
 
 		 213 aa  221  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  51.9 
 
 		 213 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  49.54 
 
 		 216 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  51.9 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  51.9 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  50.46 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  51.42 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  49.77 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 214 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  49.52 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  48.11 
 
 		 215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 		 216 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  51.17 
 
 		 216 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  48.18 
 
 		 220 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  47.69 
 
 		 216 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  50.98 
 
 		 210 aa  211  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  47.62 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  47.62 
 
 		 214 aa  207  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  46.76 
 
 		 216 aa  205  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 213 aa  203  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  49.52 
 
 		 213 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  50.72 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 214 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  45.12 
 
 		 217 aa  201  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 		 214 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  46.7 
 
 		 215 aa  201  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 222 aa  201  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  45.54 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  49.28 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  46.51 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 216 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  54.5 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  46.23 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  45.71 
 
 		 217 aa  197  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  45.97 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  50.94 
 
 		 210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  45.12 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  46.45 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  48.33 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  45.63 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  44.34 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  47.67 
 
 		 200 aa  184  7e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>