More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0920 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0920  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 
214 aa  436  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  65.73 
 
 
218 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  65.26 
 
 
218 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  66.67 
 
 
218 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 
214 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 
214 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 
229 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  52.36 
 
 
214 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 
214 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 
214 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
216 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
216 aa  208  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
216 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  50 
 
 
216 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  50.7 
 
 
216 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  51.64 
 
 
216 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  51.42 
 
 
215 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 
216 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 
216 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 
214 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  52.11 
 
 
216 aa  202  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  51.18 
 
 
214 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 
216 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 
214 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  55.02 
 
 
210 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  48.58 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  50.94 
 
 
214 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 
214 aa  198  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  48.36 
 
 
216 aa  198  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  48.8 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  48.1 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  48.33 
 
 
214 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  46.48 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 
215 aa  194  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  46.08 
 
 
221 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 
215 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  50.71 
 
 
222 aa  191  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  45.83 
 
 
220 aa  191  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 
216 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 
213 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 
217 aa  190  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  45.71 
 
 
215 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  47.14 
 
 
213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 
230 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  49.52 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  48.08 
 
 
214 aa  187  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 
213 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  47.12 
 
 
213 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  51.05 
 
 
214 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  49.02 
 
 
206 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  45.93 
 
 
214 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  50.25 
 
 
214 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  47.62 
 
 
212 aa  185  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  50.25 
 
 
214 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 
213 aa  184  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  46.15 
 
 
213 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  45.45 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  49.75 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  47.6 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  45.24 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  43.27 
 
 
213 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  45.67 
 
 
213 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  42.47 
 
 
222 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  44.23 
 
 
213 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  45.67 
 
 
213 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  45.67 
 
 
213 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  45.97 
 
 
216 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  45.97 
 
 
216 aa  178  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  47.64 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  44.98 
 
 
215 aa  177  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  46.6 
 
 
217 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  48.4 
 
 
216 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  44.23 
 
 
213 aa  176  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  49 
 
 
200 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  47.62 
 
 
212 aa  175  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  43.69 
 
 
210 aa  174  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  45.67 
 
 
213 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  44.76 
 
 
212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  47.64 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  44.17 
 
 
210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  43.69 
 
 
212 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  46.53 
 
 
210 aa  172  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  44.98 
 
 
215 aa  171  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  45.87 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  44.71 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  44.71 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  44.71 
 
 
214 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  44.23 
 
 
214 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  45.19 
 
 
214 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  44.71 
 
 
214 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  43.96 
 
 
212 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  44.5 
 
 
214 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  44.5 
 
 
214 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  42.25 
 
 
217 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>