More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1085 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1085  putative GST-related protein  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0173017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5862  maleylacetoacetate isomerase  76.53 
 
 		 213 aa  340  7e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.123467  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5804  maleylacetoacetate isomerase  74.65 
 
 		 213 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4219  maleylacetoacetate isomerase  77.93 
 
 		 213 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.553079  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4147  maleylacetoacetate isomerase  77.93 
 
 		 213 aa  332  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202832  normal  0.0442189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3372  maleylacetoacetate isomerase  77.93 
 
 		 213 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246058  normal  0.240323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4440  maleylacetoacetate isomerase  78.4 
 
 		 213 aa  330  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.716277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1887  maleylacetoacetate isomerase  76.53 
 
 		 213 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0148  maleylacetoacetate isomerase  72.17 
 
 		 213 aa  303  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.006322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2629  maleylacetoacetate isomerase  67.44 
 
 		 216 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000227803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4524  putative maleylpyruvate isomerase (MhbI)  67.44 
 
 		 216 aa  296  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2674  maleylacetoacetate isomerase  62.26 
 
 		 213 aa  268  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  56.4 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  56.4 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2765  putative glutathione S-transferase  56.81 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  56.4 
 
 		 214 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  56.4 
 
 		 214 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  55.92 
 
 		 214 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  55.45 
 
 		 214 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32650  putative glutathione S-transferase  55.87 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0298352  hitchhiker  0.000219553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  55.45 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 		 214 aa  217  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  54.25 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  49.77 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  54.93 
 
 		 214 aa  213  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  53.3 
 
 		 214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 		 229 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 		 213 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  51.89 
 
 		 214 aa  211  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  53.08 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  52.58 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  51.17 
 
 		 215 aa  207  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  48.34 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  50.94 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 212 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  47.87 
 
 		 214 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  52.47 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  50.47 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  48.83 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  53.03 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  53.03 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  52.53 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  53.03 
 
 		 214 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  51.15 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  51.42 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  48.43 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  50.69 
 
 		 216 aa  192  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  51.36 
 
 		 222 aa  191  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  50.23 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2077  maleylacetoacetate isomerase  48.43 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.238722  normal  0.903317 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  47.89 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 212 aa  188  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  47.76 
 
 		 216 aa  187  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  49.31 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  49.54 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  52.75 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  49.51 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  43.78 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  44.7 
 
 		 216 aa  184  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  49.07 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  49.54 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  52.75 
 
 		 210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  52.29 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  47.44 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  47.12 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  46.67 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  44.91 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  48.08 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  50.46 
 
 		 212 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  42.65 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  50.78 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  47.27 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  52.83 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  48.84 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  50 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  46.92 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  47.78 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.6 
 
 		 215 aa  174  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  46.92 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 221 aa  174  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 212 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  42.92 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  49.06 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  46.76 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  40.74 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3583  maleylacetoacetate isomerase  44.81 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  46.63 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  42.38 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  44.08 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>