More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5085 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  47.93 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 214 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 229 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  47.91 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  47 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  47 
 
 		 216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 216 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 214 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  46.98 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  47 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  48.57 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 212 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  42.93 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  45.62 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  47.92 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  45.02 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1719  maleylacetoacetate isomerase  45.45 
 
 		 220 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.684414  normal  0.044908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  47.92 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  49.53 
 
 		 216 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  45.62 
 
 		 216 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  47.4 
 
 		 214 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  48.61 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  47.4 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  46.79 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  46.54 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  43.93 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  51.16 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0964  maleylacetoacetate isomerase  44.6 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 214 aa  185  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  48.37 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  44.55 
 
 		 215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1191  maleylacetoacetate isomerase  50.93 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.916605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3762  maleylacetoacetate isomerase  42.99 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  46.26 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  43.93 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02180  hypothetical protein  42.72 
 
 		 222 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  45.16 
 
 		 216 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1439  maleylacetoacetate isomerase  45.12 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.847177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  45.07 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  43.81 
 
 		 216 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003652  maleylacetoacetate isomerase/glutathione S-transferase  42.13 
 
 		 222 aa  177  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  47.2 
 
 		 214 aa  177  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  45.79 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  44.24 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  42.99 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  46.45 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  43.33 
 
 		 214 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  48.6 
 
 		 210 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  43.66 
 
 		 215 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  48.13 
 
 		 210 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  47.66 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  42.06 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  42.4 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  44.17 
 
 		 210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  46.73 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  44.22 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  42.99 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0908  maleylacetoacetate isomerase  46.95 
 
 		 218 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.925505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5152  maleylacetoacetate isomerase  46.01 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.357213  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 		 212 aa  168  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  47.34 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  43.2 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  42.25 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03149  maleylacetoacetate isomerase  43.6 
 
 		 220 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  43.72 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  45.45 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1019  maleylacetoacetate isomerase  46.48 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.584157 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1851  maleylacetoacetate isomerase  41.23 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  41.12 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2090  maleylacetoacetate isomerase  40.65 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  43.98 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1872  maleylacetoacetate isomerase  40.65 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  41.26 
 
 		 222 aa  157  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  42.72 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  44.39 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  39.17 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3597  maleylacetoacetate isomerase  43.11 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169924  normal  0.0485989 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2474  maleylacetoacetate isomerase  40.81 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.388492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1678  maleylacetoacetate isomerase  41.26 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.914893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>