More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3434 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.25 
 
 
211 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  64.9 
 
 
208 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.88 
 
 
208 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  64.88 
 
 
208 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.88 
 
 
208 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.39 
 
 
208 aa  290  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 
208 aa  288  6e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 
208 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.02 
 
 
208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  54.68 
 
 
203 aa  247  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  58.12 
 
 
209 aa  241  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  52.71 
 
 
204 aa  238  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  50.49 
 
 
204 aa  229  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  42.16 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  44.92 
 
 
186 aa  160  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  40.98 
 
 
203 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 
219 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  37.14 
 
 
209 aa  148  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  36.02 
 
 
215 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  32.7 
 
 
215 aa  126  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  32.23 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  32.86 
 
 
209 aa  124  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 
211 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 
203 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
210 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.72 
 
 
204 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  32.14 
 
 
216 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  33.97 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  34.93 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  34.93 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
205 aa  108  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.37 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 
206 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  34.78 
 
 
206 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.22 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 
206 aa  92  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  30.95 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.94 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
230 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.91 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0412  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  30.99 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.15 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.7 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  28.14 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  29.47 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  27.7 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  27.72 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  29.95 
 
 
233 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  29.47 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  27.32 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  27.88 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  27.59 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  32.05 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  26.87 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.33 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  30.77 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
252 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2712  glutathione S-transferase-like  31.34 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  28.82 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  28.16 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.87 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  27.62 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  26 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  27.7 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  27.32 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  28.36 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  27.27 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  26.63 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  25.85 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  29.21 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  20.85 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4938  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.78 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2866  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0201506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  27.17 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  29.79 
 
 
217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4359  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  29.45 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  29.45 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2019  maleylacetoacetate isomerase  30.18 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.70314  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  26.5 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  25.87 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  25.47 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00391  glutathione S-transferase  29.13 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  29.85 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>