More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05596 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  82.67 
 
 
204 aa  353  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  70.44 
 
 
203 aa  309  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.41 
 
 
208 aa  261  4e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.21 
 
 
208 aa  255  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.43 
 
 
208 aa  255  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  56.93 
 
 
208 aa  254  7e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 
208 aa  247  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  55.94 
 
 
208 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.94 
 
 
208 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
208 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.59 
 
 
211 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.71 
 
 
210 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  57.29 
 
 
209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 
205 aa  145  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  37.81 
 
 
202 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  40.1 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 
219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  37.16 
 
 
186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  32.21 
 
 
215 aa  124  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.22 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  33.17 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.29 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  29.81 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  30.48 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
210 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 
210 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  30 
 
 
209 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
206 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.23 
 
 
204 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 
205 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 
205 aa  99  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.38 
 
 
205 aa  92  5e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  27.32 
 
 
203 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  27.09 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  25.85 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  26.83 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  34.09 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.06 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  29.58 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.53 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  26.96 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  26.76 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  23.65 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  25.37 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  25.37 
 
 
203 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  26.47 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  28.89 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.11 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.11 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  27.94 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.75 
 
 
198 aa  72  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  30.29 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  25.51 
 
 
200 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  25.37 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  26.07 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  24.49 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  25 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  25.51 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  28.43 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1299  Glutathione S-transferase domain protein  29.5 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692637  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.6 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1641  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.606226  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  23.98 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  29.36 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  26.96 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.96 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003296  glutathione transferase  24.88 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.63 
 
 
207 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3002  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.404999  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1842  glutathione S-transferase  25 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260742  normal  0.324274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.09 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  27.4 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  26.11 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  26.89 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3827  putative glutathione S-transferase  26.07 
 
 
208 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  27.36 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  27.03 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  25 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.64 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.48 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  28.18 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3227  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.805689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  25.25 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  27.7 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  27.49 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04080  probable glutathione S-transferase  21.95 
 
 
199 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  23.38 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8513  Glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  26.73 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
233 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  26.94 
 
 
284 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>