More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2458 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 286 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  73.68 
 
 		 285 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  73.08 
 
 		 286 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  74.04 
 
 		 285 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  74.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  74.02 
 
 		 285 aa  433  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  70.59 
 
 		 289 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.64 
 
 		 289 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  71.08 
 
 		 289 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  72.36 
 
 		 290 aa  413  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  68.95 
 
 		 279 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  69.45 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  69.2 
 
 		 289 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  70.18 
 
 		 283 aa  391  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  70.76 
 
 		 284 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  70.76 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  68.1 
 
 		 280 aa  387  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  70.76 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  69.2 
 
 		 288 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  68.95 
 
 		 279 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  69.09 
 
 		 292 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  69.2 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  68.36 
 
 		 280 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  68.61 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  67.87 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  68.84 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  64.75 
 
 		 282 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.78 
 
 		 291 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  68.98 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.16 
 
 		 298 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  68 
 
 		 288 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  68 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  68.36 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  68.25 
 
 		 291 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  67.99 
 
 		 279 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  68 
 
 		 279 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  68.36 
 
 		 288 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  66.31 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  68.73 
 
 		 288 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.98 
 
 		 293 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.48 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  64.73 
 
 		 290 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  66.43 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.22 
 
 		 291 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  66.91 
 
 		 290 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  65.33 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  65.71 
 
 		 286 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  67.64 
 
 		 290 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  65.57 
 
 		 284 aa  371  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 		 286 aa  371  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.22 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  66.31 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  64 
 
 		 293 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  64 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  62.94 
 
 		 290 aa  362  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  64.36 
 
 		 292 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  64.03 
 
 		 291 aa  358  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  62.95 
 
 		 291 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.5 
 
 		 288 aa  355  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  63.9 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  58.72 
 
 		 288 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  60.28 
 
 		 290 aa  338  5.9999999999999996e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  62.16 
 
 		 280 aa  327  9e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  62.02 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  58.37 
 
 		 283 aa  298  6e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  61.35 
 
 		 262 aa  288  9e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  44.26 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  45.45 
 
 		 236 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.48 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.43 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  45.28 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  43.7 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  42.44 
 
 		 229 aa  175  8e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.74 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  46.48 
 
 		 234 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  44.05 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 		 230 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 		 230 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  45.07 
 
 		 230 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  46.48 
 
 		 230 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.07 
 
 		 230 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.13 
 
 		 234 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  40.76 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  43.52 
 
 		 233 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  44.13 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 		 230 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 		 230 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  44.81 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  41.74 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>