More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2763 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
208 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  97.6 
 
 
208 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  91.35 
 
 
208 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  90.38 
 
 
208 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  84.13 
 
 
208 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  84.13 
 
 
208 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.17 
 
 
208 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  83.17 
 
 
208 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.02 
 
 
210 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.16 
 
 
211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  61.88 
 
 
203 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  63.35 
 
 
209 aa  266  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  58.21 
 
 
204 aa  255  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  56.86 
 
 
204 aa  252  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
205 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  43 
 
 
202 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  46.27 
 
 
203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.3 
 
 
219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  41.06 
 
 
209 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  39.9 
 
 
210 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  39.42 
 
 
215 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  40.76 
 
 
186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  37.44 
 
 
215 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.78 
 
 
203 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  39 
 
 
216 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  36.06 
 
 
209 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  37.75 
 
 
203 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.38 
 
 
204 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  38.73 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.3 
 
 
205 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.57 
 
 
211 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  38.24 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.89 
 
 
206 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  36.76 
 
 
203 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.65 
 
 
210 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.69 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.76 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  36.23 
 
 
206 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.83 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 
205 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
230 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  31.53 
 
 
203 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 
230 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
198 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  30.77 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  29.76 
 
 
200 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  28.23 
 
 
210 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2139  glutathione S-transferase  32.98 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.041384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1101  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.45 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
200 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  26.57 
 
 
201 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  28.37 
 
 
204 aa  82  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  31 
 
 
222 aa  82  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 
237 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  28.57 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  30.1 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  26.57 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  31.07 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  26.09 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  29.33 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1296  glutathione S-transferase-like protein  28.99 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.041604  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2696  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3927  glutathione S-transferase-like  28.77 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  28.28 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.96 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  27.36 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  28.5 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1799  putative glutathione S-transferase (GST)  28.02 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.602523  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  28.43 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  31.28 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  27.78 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  29.35 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  30.05 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  26.32 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4810  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  28 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  25.94 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  28.92 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  26.79 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  26.79 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5413  Glutathione S-transferase domain protein  28.3 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5265  putative glutathione transferase  30.52 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0071298  normal  0.528332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  28.14 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  26.21 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2764  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>