More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1764 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  87.19 
 
 		 203 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  87.19 
 
 		 203 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.58 
 
 		 205 aa  276  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  56.65 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  37.25 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.65 
 
 		 205 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.56 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  37.75 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  38.57 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 208 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  38.03 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  35.11 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  36.27 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  35.59 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.27 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.78 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.12 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.92 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  33.49 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.1 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.07 
 
 		 202 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  34.27 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.97 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  30.14 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  31.31 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 		 231 aa  98.6  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  31.6 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 230 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.75 
 
 		 205 aa  95.5  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  29.73 
 
 		 209 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  28.29 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.84 
 
 		 232 aa  92  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  28.78 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 		 237 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  27.32 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.05 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  29.38 
 
 		 229 aa  85.1  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  30.14 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  29.76 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  30.73 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.11 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  30.11 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.11 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  31.98 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  29.57 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.44 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  28.09 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2420  glutathione S-transferase-like  28.08 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.608511  normal  0.0917886 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.16 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  30.98 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  30.98 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.31 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2738  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.34 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.42 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.42 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  27.81 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1399  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.81 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  26.32 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  26.63 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  26.97 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  27.81 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  28.09 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  29.38 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  40.62 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  27.32 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  43.16 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  28.29 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3890  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.19285 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  27.27 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  27.27 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  26.56 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7500  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  31.22 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  28.29 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  26.96 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  25.62 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  26.74 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  27.42 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  26.88 
 
 		 297 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  43.75 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4124  glutathione S-transferase-like  29.23 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.590461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  28.97 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>