230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3548 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  100 
 
 		 233 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.48 
 
 		 232 aa  340  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.8 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 205 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  33 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.43 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  32.54 
 
 		 206 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.88 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  34.3 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 206 aa  87.4  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.44 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.46 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.32 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  26.85 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  31.71 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  29.76 
 
 		 203 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.86 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  28.38 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  31.43 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  28.29 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  29.41 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  28.71 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  26.13 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.06 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  30.56 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.06 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  30.06 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.06 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.64 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.28 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  26.64 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  24.76 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.04 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  26.29 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  26.59 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  24.4 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3681  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.46 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.29 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  25.24 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.6 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.24 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0929  glutathione S-transferase  25.89 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  31.89 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  28.18 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  27.31 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  26.54 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  27.31 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  26.64 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4349  Glutathione S-transferase domain  29.89 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.313918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.19 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.89 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.43 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  24.75 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.63 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0048  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.84 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  25.47 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  26.11 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3583  maleylacetoacetate isomerase  26.24 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  26.58 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  25.57 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6902  putative glutathione S-transferase  29.24 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  27.4 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  22.07 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  27.4 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  27.4 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  24.04 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1128  glutathione S-transferase-like  28.49 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  28.49 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  28.84 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3549  maleylacetoacetate isomerase  35.53 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  22.5 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.34 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  28.4 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  24.04 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  30.86 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  25.39 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4263  glutathione S-transferase-like protein  27.52 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  24.46 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  28.84 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.91 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  25.43 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  25.43 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0240  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  25.42 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  25.63 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  25.58 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.42 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>