More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3950 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  100 
 
 		 203 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  91.63 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  87.19 
 
 		 203 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.1 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  56.16 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.49 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  39.71 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.56 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  42.18 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.13 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  40 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  39.22 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.73 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.73 
 
 		 208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  38.46 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.65 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.24 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.66 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  35.64 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.75 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  37.75 
 
 		 208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  34.91 
 
 		 203 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 208 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  35.21 
 
 		 215 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.44 
 
 		 205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  32.86 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  31.58 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 		 205 aa  104  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  34.76 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 		 210 aa  101  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  31.18 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.37 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  30.24 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  28.78 
 
 		 204 aa  95.5  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 210 aa  94.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.81 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.46 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.33 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6065  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.16 
 
 		 232 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.966478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  33 
 
 		 226 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  32.68 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  25.85 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3548  glutathione S-transferase  31.71 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0628604  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2495  putative glutathione S-transferase  33.14 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00712937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  30.43 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2604  glutathione S-transferase  31.98 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.918843  normal  0.211055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  30.1 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2420  glutathione S-transferase-like  27.55 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.608511  normal  0.0917886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2975  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.42 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.916048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  30.23 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  31.18 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1813  glutathionine S-transferase  27.32 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000409061  decreased coverage  0.000277297 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.29 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  30.65 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  41.9 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  30.05 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3226  glutathione S-transferase-like  29.65 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.74059  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  27.96 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  29.47 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  31.22 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5005  Glutathione S-transferase domain  29.21 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  30 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49100  glutathione S-transferase  25.84 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  26.32 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  29.25 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  26.47 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3292  putative glutathione S-transferase  28.23 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000024408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2158  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.64 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  28.57 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0044  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.68 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0042  Glutathione S-transferase domain protein  29.86 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.245539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  43.16 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_004310  BR1493  glutathione S-transferase family protein  29.89 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.695225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  29.25 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1447  glutathione S-transferase family protein  29.89 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  28.91 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  28.86 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  32.37 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  28.37 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  41.67 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  27.27 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  27.27 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  27.27 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>