More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2890 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  48.11 
 
 
216 aa  194  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  43 
 
 
210 aa  178  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.79 
 
 
207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  36.41 
 
 
213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  42.79 
 
 
207 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.8 
 
 
207 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  35.51 
 
 
220 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  35.19 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.11 
 
 
220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  36.79 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  34.12 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  33.65 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
221 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  34.43 
 
 
249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  29.9 
 
 
221 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  28.92 
 
 
221 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  28.43 
 
 
221 aa  91.7  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.2 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  30.73 
 
 
219 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.38 
 
 
261 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  28.78 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
225 aa  85.1  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  32.69 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  30.24 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  28.57 
 
 
241 aa  84.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1508  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.17 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5247  putative glutathione S-transferase GSTF2 (GST-II)  31.8 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  0.155796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  29.08 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.22 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  29.47 
 
 
202 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.17 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  28.17 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  28.17 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  27.7 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  25.37 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  25.94 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  30.88 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  25.25 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  27.7 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.7 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  34.15 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  28.99 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  27.7 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  28.99 
 
 
202 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  27.7 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  24.88 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  29.22 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  26.76 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.76 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  28.36 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  28.7 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  28.7 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  25.12 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  30.43 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  25.58 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  25.44 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  28.97 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  28.31 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  24.88 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  30.77 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  27.7 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1679  Glutathione S-transferase domain protein  28.86 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000555439  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  23.04 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  26.76 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  28.7 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  31.05 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  28.5 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.37 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  33.95 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  33.95 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  30.25 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  31.28 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.53 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  26.29 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0268  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  30.23 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  29.33 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  28.31 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  25.82 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>