More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2730 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.25 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.71 
 
 		 208 aa  291  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  65.71 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.71 
 
 		 208 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.24 
 
 		 208 aa  291  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  64.29 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.64 
 
 		 208 aa  284  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.64 
 
 		 208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.16 
 
 		 208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  56.04 
 
 		 203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  61.73 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  54.55 
 
 		 204 aa  244  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  54.59 
 
 		 204 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  40.19 
 
 		 202 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  39.13 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.93 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  37.91 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.8 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  35.19 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  33.95 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  32.87 
 
 		 215 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  33.02 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.92 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  35.1 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 202 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.84 
 
 		 204 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.36 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  27.62 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.78 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.48 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  30.7 
 
 		 206 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.31 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  31.46 
 
 		 203 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 205 aa  92  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  30.99 
 
 		 203 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  27.54 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  28.16 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.1 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0697  glutathione S-transferase  27.18 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2439  glutathione S-transferase-like protein  28.37 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3851  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.216591  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3670  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.84 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  26.32 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4693  glutathione S-transferase-like  25.84 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.358965  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  27.62 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  26.92 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.42 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.19 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  31.4 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  26.17 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0645  glutathione S-transferase-like  27.88 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.722095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4962  Glutathione S-transferase domain protein  28.37 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  29.57 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.07 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0196  glutathione S-transferase-like  26.76 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1435  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.09 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.53764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  27.94 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3602  Glutathione S-transferase domain  26.4 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  29.63 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  26.54 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  26.7 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2407  putative glutathione S-transferase  27.54 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00274689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1479  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00108267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  26.11 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  26.92 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4182  glutathione S-transferase-like protein  26.49 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.645028  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1486  glutathione S-transferase  26.6 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.85 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3191  Glutathione S-transferase domain  29.17 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3528  glutathione S-transferase  29.68 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8437  Glutathione S-transferase domain protein  29.03 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1821  glutathione S-transferase family protein  26.07 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2670  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  33.92 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  26.98 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.87 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6142  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5777  glutathione S-transferase-like  28.12 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184007  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  28.37 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.17 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  28.5 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3511  glutathione S-transferase-like protein  27.44 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1504  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.98 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>