More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1088 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1088  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  61.76 
 
 		 208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.25 
 
 		 208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.25 
 
 		 208 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.27 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  61.27 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.76 
 
 		 208 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.78 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.29 
 
 		 208 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.71 
 
 		 211 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.83 
 
 		 210 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0529  putative glutathione S-transferase  56.22 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000005  glutathione S-transferase  56.72 
 
 		 204 aa  241  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05596  glutathione S-transferase  55.72 
 
 		 204 aa  238  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  41.5 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3324  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.11 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00662  Glutathione S-transferase  41.3 
 
 		 186 aa  151  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1555  glutathione S-transferase-like  41.18 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  35.58 
 
 		 209 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  35.1 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  34.62 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.82 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1268  glutathione S-transferase  34.91 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.652561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  34.16 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  32.21 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.19 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3699  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  32.82 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.67 
 
 		 210 aa  111  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.82 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  31.28 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  30.77 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.33 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.49 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  35.58 
 
 		 206 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.47 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3483  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.5 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541048  normal  0.515016 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4039  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.01 
 
 		 231 aa  89.4  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  31.07 
 
 		 206 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22380  Glutathione S-transferase protein  30.48 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3893  glutathione S-transferase-like protein  29.47 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1931  glutathione S-transferase-like  28.06 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6781  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.58 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.181591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  28.17 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5541  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.38 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4952  Glutathione S-transferase domain  31.58 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3625  glutathione S-transferase-like  26.87 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4742  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.917928  hitchhiker  0.00649205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43110  putative glutathione S-transferase  29 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000318488  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  27.4 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  25.76 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1010  glutathione S-transferase-like protein  27.41 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0403399  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1633  Glutathione S-transferase domain protein  27.84 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0604815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  27.67 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  27.4 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1387  Glutathione S-transferase domain protein  24.27 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1873  Glutathione S-transferase domain protein  31.09 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.64 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3821  Glutathione S-transferase domain  26.96 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.14 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  28.28 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  24.49 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.96 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5174  glutathione S-transferase-like  30.1 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  27.64 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.64 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3617  putative glutathione S-transferase  28.5 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  29.52 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2218  Glutathione S-transferase domain  30.63 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3209  glutathione S-transferase-like protein  31.25 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  27.45 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  28.44 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0661  Glutathione S-transferase domain protein  29.52 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  28.3 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.61 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0668  glutathione S-transferase-like  25.44 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0464082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0418  glutathione S-transferase  26.63 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0882437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1421  glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2981  glutathione S-transferase  26.67 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.897939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2032  glutathione S-transferase family protein  27.05 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22229  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6622  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.79 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.25172  normal  0.643167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  28.22 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3211  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>