More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6370 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  93.81 
 
 
291 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  84.08 
 
 
291 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  84.45 
 
 
284 aa  507  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  80.84 
 
 
291 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  80.48 
 
 
291 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  80.69 
 
 
292 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.45 
 
 
294 aa  490  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  76.63 
 
 
293 aa  484  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.82 
 
 
291 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  77.66 
 
 
293 aa  481  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  79.09 
 
 
292 aa  483  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.17 
 
 
293 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.55 
 
 
291 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  77.59 
 
 
290 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  77.16 
 
 
290 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  75.52 
 
 
292 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  75 
 
 
293 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  75 
 
 
293 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  75.43 
 
 
290 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  73.01 
 
 
291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  74.83 
 
 
289 aa  441  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  76.09 
 
 
280 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  73.43 
 
 
286 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  76.36 
 
 
280 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  74.04 
 
 
290 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  75.36 
 
 
279 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  74.64 
 
 
279 aa  432  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.82 
 
 
288 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  73.93 
 
 
279 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  69.47 
 
 
290 aa  428  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  71.93 
 
 
289 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  424  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  74.91 
 
 
279 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  72.14 
 
 
304 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  71.07 
 
 
288 aa  424  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  72.86 
 
 
279 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  71.07 
 
 
288 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  70.92 
 
 
283 aa  421  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 
288 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  68.26 
 
 
298 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  72.26 
 
 
280 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  72.36 
 
 
286 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.68 
 
 
279 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  66.9 
 
 
290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  69.75 
 
 
286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  69.04 
 
 
285 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  70.91 
 
 
285 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 
288 aa  398  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  64.87 
 
 
282 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.43 
 
 
286 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  61.72 
 
 
285 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  65.69 
 
 
285 aa  374  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 
284 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  67.39 
 
 
283 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  63.6 
 
 
285 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  66.43 
 
 
284 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  62.28 
 
 
289 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  66.3 
 
 
289 aa  360  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.14 
 
 
289 aa  359  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  61.54 
 
 
290 aa  350  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  63.04 
 
 
280 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  64.06 
 
 
280 aa  332  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  58.04 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 
230 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
233 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  49.77 
 
 
230 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  45.34 
 
 
229 aa  195  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
230 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
230 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.83 
 
 
230 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  48.83 
 
 
230 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  44.69 
 
 
233 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
230 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  44.4 
 
 
234 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  44.35 
 
 
255 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  45.22 
 
 
230 aa  185  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.22 
 
 
230 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  45.74 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  43.48 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.22 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.22 
 
 
231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  44.93 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  43.91 
 
 
234 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.33 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.44 
 
 
211 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  47.44 
 
 
211 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  43.72 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  45.37 
 
 
230 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>