More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1080 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  92.5 
 
 		 280 aa  540  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  67.42 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.27 
 
 		 293 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  65.37 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.09 
 
 		 291 aa  346  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  66.93 
 
 		 292 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  63.98 
 
 		 286 aa  345  7e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 291 aa  344  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  64.34 
 
 		 286 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  66.54 
 
 		 291 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  65.37 
 
 		 289 aa  342  5e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  65.23 
 
 		 293 aa  341  8e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.12 
 
 		 291 aa  340  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  62.69 
 
 		 283 aa  340  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  62.88 
 
 		 298 aa  338  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  63.85 
 
 		 279 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  62.65 
 
 		 285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  64.98 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  64.2 
 
 		 290 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  62.55 
 
 		 282 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  62.07 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  63.42 
 
 		 280 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  62.07 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  64.31 
 
 		 284 aa  332  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  64.06 
 
 		 291 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  61.09 
 
 		 286 aa  332  6e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  62.55 
 
 		 279 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  63.67 
 
 		 279 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  62.02 
 
 		 285 aa  329  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  60.85 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  62.79 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  62.79 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  63.57 
 
 		 290 aa  329  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  61.48 
 
 		 285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  62.79 
 
 		 293 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  63.28 
 
 		 285 aa  328  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  62.99 
 
 		 304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  64.34 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.85 
 
 		 288 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.02 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  63.04 
 
 		 290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  60.15 
 
 		 289 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  61.63 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  61.69 
 
 		 293 aa  322  5e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.71 
 
 		 294 aa  322  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.33 
 
 		 289 aa  322  6e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  61.24 
 
 		 291 aa  321  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  62.02 
 
 		 292 aa  321  8e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.87 
 
 		 279 aa  321  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  61.24 
 
 		 288 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  60.47 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  61.24 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  60.85 
 
 		 288 aa  318  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  60.85 
 
 		 288 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  61.09 
 
 		 292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  59.69 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  60.7 
 
 		 279 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  60.31 
 
 		 279 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  56.99 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  61.33 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  60.94 
 
 		 283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  60.94 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 		 289 aa  298  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  57.75 
 
 		 288 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  58.24 
 
 		 290 aa  286  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  55.3 
 
 		 262 aa  275  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  45.21 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  45.5 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  44.84 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  44.59 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  45.5 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  44.84 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 		 261 aa  179  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  44.84 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.59 
 
 		 230 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 		 233 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  43.69 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  43.84 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  42.79 
 
 		 213 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  42.79 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.69 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  43.75 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  43.69 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  42.92 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  40.56 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  42.2 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.58 
 
 		 231 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.24 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.11 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2356  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 231 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.727095  normal  0.759531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>