More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3487 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 288 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  98.96 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  98.96 
 
 		 288 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  98.96 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  98.61 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  93.03 
 
 		 288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  92.68 
 
 		 288 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  91.64 
 
 		 288 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  82.01 
 
 		 289 aa  494  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  72.03 
 
 		 292 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  69.9 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  68.4 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  70.18 
 
 		 290 aa  425  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  70.28 
 
 		 291 aa  424  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.42 
 
 		 291 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  70.28 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  70 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  70.71 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  70.53 
 
 		 291 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  71.58 
 
 		 284 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.96 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  69.55 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.73 
 
 		 291 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  68.88 
 
 		 290 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  68.18 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  72.46 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  72.14 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  72.4 
 
 		 284 aa  407  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  71.17 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  72.4 
 
 		 284 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  68.71 
 
 		 286 aa  407  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  69.89 
 
 		 280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  69.64 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  68.35 
 
 		 279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  67.25 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  68.33 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  70.5 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  67.96 
 
 		 286 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  67.25 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  67.49 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.15 
 
 		 294 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  69.18 
 
 		 279 aa  401  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  70.91 
 
 		 279 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  69.42 
 
 		 280 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 		 292 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.02 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  69.04 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  70.91 
 
 		 279 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  67.5 
 
 		 280 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  68.48 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.93 
 
 		 279 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  72.36 
 
 		 289 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  68.84 
 
 		 285 aa  394  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  65.62 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  66.3 
 
 		 283 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.73 
 
 		 286 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  64.39 
 
 		 285 aa  377  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  60.07 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  63.44 
 
 		 282 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.3 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  63.67 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  60.71 
 
 		 290 aa  360  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  60 
 
 		 290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  61.24 
 
 		 280 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  56.42 
 
 		 283 aa  294  1e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  61.13 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  48.9 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 230 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  45.29 
 
 		 229 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  48.6 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.87 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  46.08 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.3 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.3 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  47.95 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.8 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  49.77 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.91 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  47.25 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  44.64 
 
 		 214 aa  176  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  43.97 
 
 		 230 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  43.75 
 
 		 213 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.7 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  43.7 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.54 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.33 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.51 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  40.07 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>