More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2933 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  98.21 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  96.06 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  89.57 
 
 		 279 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  80.29 
 
 		 279 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  77.42 
 
 		 304 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  77.06 
 
 		 280 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  77.34 
 
 		 279 aa  448  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.56 
 
 		 279 aa  447  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  76.26 
 
 		 279 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  76.09 
 
 		 291 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  75.71 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  75.71 
 
 		 290 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  74.45 
 
 		 283 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  73.99 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.82 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  73.21 
 
 		 292 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  73.19 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  72.76 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  73.55 
 
 		 291 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  68.1 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  72.26 
 
 		 291 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  73.72 
 
 		 286 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.22 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  73.36 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  72 
 
 		 291 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  71.27 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  70.44 
 
 		 293 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 		 282 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 		 286 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.62 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  69.64 
 
 		 289 aa  410  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  71.33 
 
 		 289 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  70.91 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  69.89 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  70.25 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  68.82 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  69.89 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  69.64 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  69.89 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 288 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.48 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  68.93 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  70.07 
 
 		 286 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  69.34 
 
 		 285 aa  397  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  68.61 
 
 		 285 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  64.46 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  68.13 
 
 		 285 aa  391  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.36 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  63.67 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  65.82 
 
 		 293 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  66.19 
 
 		 292 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  66.18 
 
 		 293 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  68.82 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  65.14 
 
 		 289 aa  377  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  68.46 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.69 
 
 		 289 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  67.77 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  62.91 
 
 		 288 aa  360  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  63 
 
 		 290 aa  359  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  63.12 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  62.07 
 
 		 280 aa  333  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  60.92 
 
 		 280 aa  328  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  60.24 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  55.38 
 
 		 283 aa  295  8e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.68 
 
 		 233 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.93 
 
 		 230 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  49.07 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.61 
 
 		 230 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  49.07 
 
 		 230 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 		 230 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  47.69 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  48.61 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  47.22 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  46.12 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  45.38 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  45.37 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.3 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  46.02 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  44.7 
 
 		 234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  43.32 
 
 		 362 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  47.03 
 
 		 236 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.3 
 
 		 231 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  47.22 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.12 
 
 		 242 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  44.17 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>