More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3240 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 
285 aa  590  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  87.72 
 
 
285 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  76.49 
 
 
286 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  77.54 
 
 
285 aa  467  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  73.36 
 
 
289 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.04 
 
 
286 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  71.83 
 
 
285 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.88 
 
 
289 aa  425  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  70 
 
 
290 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  71.33 
 
 
286 aa  414  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246613 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  71.17 
 
 
288 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  70.91 
 
 
288 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  70.8 
 
 
288 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  70.8 
 
 
288 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  70.55 
 
 
288 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  67.51 
 
 
282 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  70.8 
 
 
288 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  69.47 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  69.04 
 
 
289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  70.18 
 
 
288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  70.44 
 
 
288 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  71.27 
 
 
283 aa  404  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  68.1 
 
 
285 aa  397  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  67.97 
 
 
291 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  67.97 
 
 
292 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 
290 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  67.52 
 
 
279 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  67.87 
 
 
279 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  66.91 
 
 
279 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.07 
 
 
291 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 
279 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  68.25 
 
 
291 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 
280 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  66.31 
 
 
304 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  64.6 
 
 
290 aa  384  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.39 
 
 
279 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  67.15 
 
 
279 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  67.4 
 
 
280 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  65.59 
 
 
280 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  67.27 
 
 
284 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  67.27 
 
 
283 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  67.27 
 
 
284 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  65.12 
 
 
286 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  64.98 
 
 
293 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  65.48 
 
 
290 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  63.93 
 
 
289 aa  374  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  63.83 
 
 
298 aa  376  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  63.96 
 
 
291 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.21 
 
 
291 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  63.35 
 
 
290 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  63.6 
 
 
291 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  62.9 
 
 
292 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  64.03 
 
 
284 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.78 
 
 
293 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.44 
 
 
294 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.6 
 
 
288 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  61.87 
 
 
291 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  61.48 
 
 
291 aa  361  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  59.79 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  59.79 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  63.18 
 
 
293 aa  354  8.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  59.79 
 
 
292 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  59.27 
 
 
290 aa  350  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  61.78 
 
 
280 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  59.93 
 
 
290 aa  330  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  62.02 
 
 
280 aa  329  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  57.3 
 
 
288 aa  329  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  58.75 
 
 
283 aa  306  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  60.56 
 
 
262 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  46.95 
 
 
230 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  45.54 
 
 
230 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  46.73 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  44.24 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  44.39 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  40.34 
 
 
255 aa  172  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  43.87 
 
 
230 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.32 
 
 
233 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  42.99 
 
 
234 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 
261 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.33 
 
 
231 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  43.52 
 
 
236 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  42.06 
 
 
214 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.78 
 
 
230 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.31 
 
 
233 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  40.65 
 
 
213 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  41.47 
 
 
233 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.41 
 
 
232 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  43.72 
 
 
234 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.32 
 
 
230 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.7 
 
 
242 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.4 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  41.4 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  44.7 
 
 
232 aa  165  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  42.72 
 
 
229 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>