More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1834 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  84.08 
 
 		 291 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  83.04 
 
 		 291 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  84.53 
 
 		 284 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  80.49 
 
 		 291 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  81.05 
 
 		 292 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  79.51 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.89 
 
 		 291 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  78.69 
 
 		 292 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  78.77 
 
 		 291 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  77.16 
 
 		 293 aa  480  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  78.62 
 
 		 291 aa  477  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  77.51 
 
 		 294 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  78.82 
 
 		 293 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  76.9 
 
 		 292 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  75.69 
 
 		 293 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  75.69 
 
 		 293 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  75.95 
 
 		 290 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  77.14 
 
 		 283 aa  458  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  74.91 
 
 		 290 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  74.23 
 
 		 290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  74.05 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  74.05 
 
 		 290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.89 
 
 		 288 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  74.91 
 
 		 289 aa  431  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  73.33 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  69.66 
 
 		 290 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  71.23 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  70.88 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  73.21 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  70.53 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  72.5 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  71.48 
 
 		 304 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  70.53 
 
 		 288 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  72.26 
 
 		 280 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  67.24 
 
 		 298 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  71.12 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  69.82 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  70.18 
 
 		 288 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  69.82 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  69.82 
 
 		 288 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  70.76 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  71.12 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  72.16 
 
 		 280 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  70.28 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  70.55 
 
 		 286 aa  411  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  71.17 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  67.94 
 
 		 290 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  67.14 
 
 		 282 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.61 
 
 		 279 aa  407  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  68.36 
 
 		 285 aa  394  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  67.51 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  66.08 
 
 		 288 aa  390  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  68.25 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  67.15 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  66.2 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.25 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  62.86 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  66.43 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 		 283 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  63.67 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 		 289 aa  363  2e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.77 
 
 		 289 aa  353  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  62.24 
 
 		 290 aa  351  5.9999999999999994e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  64.98 
 
 		 280 aa  347  1e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 280 aa  344  8.999999999999999e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 		 283 aa  315  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  57.81 
 
 		 262 aa  294  9e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.95 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  47.22 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  48.15 
 
 		 230 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  47.22 
 
 		 230 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  47.22 
 
 		 230 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  46.76 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  46.02 
 
 		 255 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.76 
 
 		 230 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  47.73 
 
 		 234 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  46.12 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.3 
 
 		 230 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  43.53 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  43.37 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 		 230 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  45.37 
 
 		 234 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  45.16 
 
 		 234 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  46.76 
 
 		 230 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.3 
 
 		 231 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  42.97 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  44.75 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  45.74 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.74 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>