More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1381 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 
280 aa  578  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  92.5 
 
 
280 aa  540  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  65.92 
 
 
283 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  65.12 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.81 
 
 
293 aa  353  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  65.13 
 
 
286 aa  352  5e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.36 
 
 
291 aa  350  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  66.93 
 
 
292 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  64.98 
 
 
291 aa  347  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.5 
 
 
291 aa  346  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  66.28 
 
 
291 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  65.37 
 
 
293 aa  345  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  62.36 
 
 
286 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  61.51 
 
 
283 aa  343  2e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  64.02 
 
 
298 aa  342  4e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  63.71 
 
 
282 aa  340  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  65.12 
 
 
289 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  62.65 
 
 
285 aa  337  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  63.32 
 
 
290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  62.88 
 
 
293 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  63.81 
 
 
291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  62.88 
 
 
293 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  61.09 
 
 
286 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  63.04 
 
 
291 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  63.57 
 
 
290 aa  333  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  63.14 
 
 
284 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  61.78 
 
 
285 aa  333  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  62.02 
 
 
290 aa  332  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  61.24 
 
 
285 aa  332  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  62.31 
 
 
279 aa  331  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  63.04 
 
 
280 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  64.34 
 
 
290 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  63.18 
 
 
290 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  61.09 
 
 
285 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  60.92 
 
 
280 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  60.92 
 
 
280 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  62.79 
 
 
292 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  62.11 
 
 
279 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.71 
 
 
294 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.16 
 
 
286 aa  327  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.22 
 
 
288 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.26 
 
 
289 aa  326  3e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  60.54 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  61.09 
 
 
285 aa  322  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  61.81 
 
 
304 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  59.77 
 
 
289 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  60.92 
 
 
293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  60.47 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 
288 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.09 
 
 
279 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  60.08 
 
 
291 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  60.08 
 
 
288 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  58.91 
 
 
288 aa  317  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  59.69 
 
 
288 aa  316  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  58.53 
 
 
288 aa  316  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  59.69 
 
 
288 aa  315  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  60.7 
 
 
292 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  59.3 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  59.92 
 
 
279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  59.69 
 
 
279 aa  311  7.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  57.53 
 
 
289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  57.75 
 
 
288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  57.98 
 
 
289 aa  300  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 
284 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 
283 aa  299  4e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 
284 aa  298  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  56.93 
 
 
290 aa  285  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  56.44 
 
 
262 aa  280  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 
233 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  43.95 
 
 
239 aa  178  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.09 
 
 
233 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05780  Glutathione S-transferase-like protein  44.34 
 
 
229 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.713113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  43.95 
 
 
229 aa  175  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  44.59 
 
 
213 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0332  glutathione S-transferase-like protein  43.38 
 
 
229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  42.92 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  42.79 
 
 
230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  43.69 
 
 
230 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.79 
 
 
230 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  43.24 
 
 
230 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  44.2 
 
 
233 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1653  Glutathione S-transferase domain protein  43.19 
 
 
233 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  41.52 
 
 
229 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.99 
 
 
235 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1416  glutathione S-transferase  42.48 
 
 
230 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.664683  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  41.89 
 
 
230 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1701  Glutathione S-transferase domain protein  41.89 
 
 
233 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  41.3 
 
 
236 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  40.83 
 
 
235 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  41.89 
 
 
214 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  43.64 
 
 
236 aa  168  9e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  43.89 
 
 
229 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>