More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0658 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 290 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  74.23 
 
 		 291 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  76.47 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  75.09 
 
 		 290 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  76.68 
 
 		 286 aa  455  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.84 
 
 		 291 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  73.36 
 
 		 292 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  72.51 
 
 		 293 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  71.43 
 
 		 290 aa  447  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  74.05 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.58 
 
 		 291 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  75.36 
 
 		 285 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.43 
 
 		 293 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  73.33 
 
 		 291 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  74.04 
 
 		 291 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  69.9 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  72.57 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  73.02 
 
 		 286 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  72.7 
 
 		 286 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  69.1 
 
 		 288 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.58 
 
 		 294 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  72.07 
 
 		 292 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  68.4 
 
 		 288 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  68.4 
 
 		 288 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  68.75 
 
 		 288 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  68.06 
 
 		 288 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  68.06 
 
 		 288 aa  427  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  70.45 
 
 		 293 aa  428  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  69.69 
 
 		 290 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  70.45 
 
 		 293 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  72.04 
 
 		 283 aa  427  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  70.45 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  72.76 
 
 		 280 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  68.4 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  67.71 
 
 		 288 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  72.04 
 
 		 284 aa  425  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  74.1 
 
 		 279 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.77 
 
 		 298 aa  421  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  69.75 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  72.04 
 
 		 279 aa  421  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  73.02 
 
 		 280 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 		 280 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  68.99 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  70.77 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  72.3 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.76 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 		 279 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  70 
 
 		 285 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  69.89 
 
 		 304 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  71.22 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.36 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.46 
 
 		 288 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  70.07 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  68.06 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  68.21 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  67.63 
 
 		 289 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.25 
 
 		 289 aa  396  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  64.03 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  67.77 
 
 		 289 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 		 283 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  67.03 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  67.03 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  61.54 
 
 		 288 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  64.56 
 
 		 290 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  65.12 
 
 		 280 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  65.37 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  58.37 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  59.85 
 
 		 262 aa  299  4e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  47.22 
 
 		 236 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.3 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 		 230 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  45.29 
 
 		 255 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  44.7 
 
 		 234 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.33 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  44.39 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  45.79 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  44.81 
 
 		 213 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  42.42 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0626  glutathione S-transferase family protein  45.21 
 
 		 236 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.679166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2655  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.25 
 
 		 235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  43.98 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  43.93 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  41.88 
 
 		 239 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.93 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  45.02 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  43.33 
 
 		 230 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  42.27 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.91 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0624  glutathione S-transferase family protein  44.75 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  42.92 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>