More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1932 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  76.47 
 
 		 290 aa  458  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.12 
 
 		 291 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  74.48 
 
 		 291 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  76.41 
 
 		 286 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  75 
 
 		 293 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  74.83 
 
 		 291 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  74.83 
 
 		 291 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  74.74 
 
 		 292 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  76.06 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  72.76 
 
 		 293 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  74.19 
 
 		 290 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  74.91 
 
 		 291 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  71.63 
 
 		 290 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  72.79 
 
 		 284 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  71.53 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  74.11 
 
 		 291 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  71.68 
 
 		 280 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  68.42 
 
 		 290 aa  417  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  72.76 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.98 
 
 		 294 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  73.36 
 
 		 283 aa  418  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  70.97 
 
 		 304 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  69.76 
 
 		 290 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  71.58 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  71.94 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  71.33 
 
 		 280 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  71.22 
 
 		 280 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.09 
 
 		 279 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  72.3 
 
 		 279 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  71.43 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  70.97 
 
 		 279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  69.34 
 
 		 293 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  69.52 
 
 		 293 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  68.88 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  69.93 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  68.99 
 
 		 293 aa  401  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  65.74 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  68.9 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  67.03 
 
 		 282 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  68.28 
 
 		 292 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.19 
 
 		 298 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.72 
 
 		 288 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 288 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.2 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 288 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  65.97 
 
 		 288 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  65.62 
 
 		 288 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  65.47 
 
 		 285 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  66.43 
 
 		 285 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  63.93 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  65.58 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  63.96 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  62.32 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  63.96 
 
 		 283 aa  354  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.96 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  62.23 
 
 		 288 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  63.96 
 
 		 284 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  63.6 
 
 		 284 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  63.93 
 
 		 289 aa  349  4e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  65.37 
 
 		 280 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  62.14 
 
 		 290 aa  340  2e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  65.12 
 
 		 280 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  58.75 
 
 		 283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  55.51 
 
 		 262 aa  269  5e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  47.93 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.19 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.33 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0551186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.8 
 
 		 233 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.76 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  44.2 
 
 		 213 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.95 
 
 		 235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  41.95 
 
 		 229 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 		 233 aa  165  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  40.17 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1203  glutathione S-transferase-like  44.19 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  44.91 
 
 		 228 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1682  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.19 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  39.92 
 
 		 362 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  45.12 
 
 		 234 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.12 
 
 		 234 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.65 
 
 		 232 aa  162  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.26 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1655  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.72 
 
 		 234 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440036  normal  0.557594 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.52 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.12 
 
 		 234 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4144  glutathione S-transferase-like protein  40.6 
 
 		 235 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.547927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  43.26 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  42.59 
 
 		 234 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>