More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3971 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  83.52 
 
 
279 aa  481  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  81.29 
 
 
279 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  80.58 
 
 
279 aa  472  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  80.29 
 
 
280 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  80 
 
 
304 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  79.78 
 
 
279 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  79.56 
 
 
280 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  79.56 
 
 
279 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  79.56 
 
 
280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  74.45 
 
 
290 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  73.12 
 
 
283 aa  428  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  73.02 
 
 
286 aa  424  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.12 
 
 
291 aa  419  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  72.4 
 
 
293 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  72.76 
 
 
290 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  69.18 
 
 
282 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  71.68 
 
 
291 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  71.79 
 
 
291 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 
291 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  74.09 
 
 
289 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  71.07 
 
 
290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.42 
 
 
293 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.53 
 
 
291 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  71.43 
 
 
289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  71.69 
 
 
284 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  71.68 
 
 
291 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  71.33 
 
 
292 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  70.36 
 
 
292 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  71.33 
 
 
288 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  69.18 
 
 
291 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  71.33 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  70.65 
 
 
288 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  70.97 
 
 
288 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  67.84 
 
 
298 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  69.93 
 
 
288 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  69.93 
 
 
288 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  70.29 
 
 
288 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.62 
 
 
294 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  70.29 
 
 
288 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.62 
 
 
288 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  70.7 
 
 
285 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  69.64 
 
 
291 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  67.39 
 
 
285 aa  390  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  68.84 
 
 
286 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  65.59 
 
 
285 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  67.39 
 
 
285 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  66.43 
 
 
293 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  65.71 
 
 
293 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  65.71 
 
 
293 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  67.14 
 
 
289 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  66.67 
 
 
286 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  66.79 
 
 
292 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.48 
 
 
286 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  66.43 
 
 
290 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  65.94 
 
 
285 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 
290 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.58 
 
 
289 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  68.48 
 
 
289 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 
284 aa  360  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  66.67 
 
 
283 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  65.95 
 
 
284 aa  357  9e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  62.5 
 
 
290 aa  357  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  61.73 
 
 
288 aa  343  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  62.63 
 
 
290 aa  339  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  61.87 
 
 
280 aa  321  8e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  61.09 
 
 
280 aa  319  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  59.38 
 
 
283 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  58.2 
 
 
262 aa  288  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.03 
 
 
233 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  46.76 
 
 
255 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  43.98 
 
 
227 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  44.75 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.08 
 
 
230 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  46.12 
 
 
236 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  46.08 
 
 
230 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  43.52 
 
 
230 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  42.37 
 
 
229 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.04 
 
 
234 aa  170  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0528  putative glutathione S-transferase  43.93 
 
 
222 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  45.79 
 
 
213 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.75 
 
 
208 aa  169  5e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.8 
 
 
230 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  44.8 
 
 
230 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  44.6 
 
 
229 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 
230 aa  168  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.91 
 
 
242 aa  168  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  41.67 
 
 
234 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  42.28 
 
 
362 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  43.78 
 
 
234 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.89 
 
 
230 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  43.04 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  44.59 
 
 
230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1547  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
234 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>