More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2143 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 289 aa  594  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  73.33 
 
 		 285 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  70.88 
 
 		 285 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  69.12 
 
 		 286 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.64 
 
 		 286 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  69.47 
 
 		 285 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  69.4 
 
 		 285 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  66.78 
 
 		 289 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  68.25 
 
 		 290 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  66.67 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  67.26 
 
 		 286 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  67.87 
 
 		 289 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  64.23 
 
 		 282 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  67.4 
 
 		 279 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  63.9 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  65.69 
 
 		 280 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  64.62 
 
 		 304 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  65.93 
 
 		 280 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  67.03 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  64.96 
 
 		 290 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  65.69 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  66.67 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  63.54 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  66.2 
 
 		 289 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  66.67 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 		 291 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  66.67 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  66.3 
 
 		 288 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.58 
 
 		 279 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  65.69 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  66.18 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  65.36 
 
 		 292 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.21 
 
 		 291 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  66.42 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  65.58 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  64.23 
 
 		 279 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  63.41 
 
 		 286 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  65.22 
 
 		 288 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  65.22 
 
 		 288 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  64.23 
 
 		 291 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  63.18 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  63.21 
 
 		 284 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  63.21 
 
 		 283 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.65 
 
 		 293 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  62.86 
 
 		 284 aa  362  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.05 
 
 		 288 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  63.14 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  62.19 
 
 		 292 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  61.57 
 
 		 293 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  61.57 
 
 		 293 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.78 
 
 		 291 aa  354  7.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  60.21 
 
 		 298 aa  353  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  61.96 
 
 		 289 aa  354  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  62.77 
 
 		 291 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  62.13 
 
 		 284 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.7 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  63.54 
 
 		 293 aa  347  2e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  61.31 
 
 		 291 aa  344  8e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  60.36 
 
 		 290 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  60.29 
 
 		 292 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  58.39 
 
 		 290 aa  342  5e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  59.44 
 
 		 290 aa  338  8e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  59.71 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  58.55 
 
 		 290 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  62.26 
 
 		 280 aa  326  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  61.33 
 
 		 280 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  54.45 
 
 		 288 aa  318  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  55.25 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  54.55 
 
 		 262 aa  265  8e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  44.91 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  41.12 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  42.79 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3976  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.26 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.2 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.78 
 
 		 230 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1531  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.04 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.195621  normal  0.284704 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  39.35 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  40.38 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  38.93 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.2 
 
 		 242 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  40.09 
 
 		 230 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  39.72 
 
 		 234 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.83 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2123  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0345909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1980  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0831  Glutathione S-transferase domain protein  41.47 
 
 		 227 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0286662 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1961  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0909  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0259435  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.13 
 
 		 237 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0251  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288754  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1375  glutathione S-transferase-like  39.09 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1591  putative glutathione S-transferase  40.93 
 
 		 234 aa  155  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.161795  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2631  glutathione S-transferase-like  39.07 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>