More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3680 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 		 282 aa  591  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  73.12 
 
 		 290 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  70.65 
 
 		 283 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.4 
 
 		 288 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  69.29 
 
 		 293 aa  421  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  68.1 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  69.18 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  68.21 
 
 		 293 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  70.21 
 
 		 286 aa  417  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  66.07 
 
 		 280 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  68.35 
 
 		 279 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  68.1 
 
 		 304 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  67.63 
 
 		 279 aa  411  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  66.43 
 
 		 280 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  66.55 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.51 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.18 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.4 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  67.51 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  67.14 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  65.36 
 
 		 292 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 		 290 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  66.79 
 
 		 291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 		 286 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  65.59 
 
 		 279 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.63 
 
 		 294 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  67.86 
 
 		 289 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  67.03 
 
 		 289 aa  398  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  65.7 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  64.87 
 
 		 291 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  65.11 
 
 		 291 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  65.72 
 
 		 293 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  65.72 
 
 		 292 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  65.25 
 
 		 291 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  65.72 
 
 		 293 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  63.12 
 
 		 290 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  64.6 
 
 		 284 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  65.69 
 
 		 292 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  65.33 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  66.06 
 
 		 291 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.75 
 
 		 286 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  62.77 
 
 		 290 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  65.59 
 
 		 288 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  66.31 
 
 		 288 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  65.95 
 
 		 288 aa  386  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  63.9 
 
 		 286 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.23 
 
 		 289 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  61.21 
 
 		 285 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  63.83 
 
 		 283 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  63.8 
 
 		 288 aa  377  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  63.8 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  64.52 
 
 		 284 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  64.16 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  63.48 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  63.44 
 
 		 288 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  61.92 
 
 		 289 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  63.87 
 
 		 285 aa  374  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  63.44 
 
 		 288 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  64.84 
 
 		 290 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  62.41 
 
 		 293 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  62.99 
 
 		 290 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  60.58 
 
 		 289 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  63.71 
 
 		 280 aa  340  1e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  58.18 
 
 		 288 aa  339  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  62.55 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  56.59 
 
 		 283 aa  308  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  58.62 
 
 		 262 aa  291  9e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  46.19 
 
 		 229 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  46.22 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.16 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  46.73 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  43.8 
 
 		 255 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  43.7 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.13 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 		 230 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.61 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3215  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.02 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.969871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1600  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.49 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  0.388565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1214  glutathione S-transferase-like protein  41.52 
 
 		 214 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2962  glutathione S-transferase-like  43.29 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.716617  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2602  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.78 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.550233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  42.06 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50970  glutathione S-transferase  43.4 
 
 		 213 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.069878  hitchhiker  0.0000421189 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0442  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.89 
 
 		 233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2390  glutathione S-transferase, putative  44.25 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.223257  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 		 230 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  42.73 
 
 		 236 aa  172  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5440  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.81 
 
 		 235 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3132  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.23 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.188559  normal  0.0740814 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.32 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  43.32 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1581  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.61 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>