More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2926 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2926  putative glutathione S-transferase YghU  100 
 
 
292 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0422082  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2519  putative glutathione S-transferase YghU  92.73 
 
 
291 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.546813 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2996  putative glutathione S-transferase YghU  87.59 
 
 
290 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2099  putative glutathione S-transferase YghU  81.03 
 
 
290 aa  497  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6370  putative glutathione S-transferase YghU  80.69 
 
 
291 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.609192 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6190  putative glutathione S-transferase YghU  81.38 
 
 
291 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.485503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1576  putative glutathione S-transferase YghU  79.31 
 
 
290 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2913  putative glutathione S-transferase  82.86 
 
 
284 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1834  putative glutathione S-transferase YghU  78.69 
 
 
291 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1100  putative glutathione S-transferase YghU  77.24 
 
 
293 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346596  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2976  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.74 
 
 
294 aa  460  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.9588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2388  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.74 
 
 
291 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.381104  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0322  glutathione S-transferase-like  74.65 
 
 
291 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4580  glutathione S-transferase domain-containing protein  74.65 
 
 
293 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0658  putative glutathione S-transferase YghU  73.36 
 
 
290 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4732  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.35 
 
 
291 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1014  glutathione S-transferase  70.34 
 
 
290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3463  putative glutathione S-transferase YghU  72.34 
 
 
293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2773  glutathione S-transferase family protein YghU  75.35 
 
 
293 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.664925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1691  Glutathione S-transferase domain  70.88 
 
 
291 aa  441  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3730  putative glutathione S-transferase YghU  72.34 
 
 
293 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1932  putative glutathione S-transferase family protein  74.74 
 
 
289 aa  444  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0416115  hitchhiker  0.0000000942316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0045  glutathione S-transferase-like protein  76 
 
 
283 aa  441  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3357  putative glutathione S-transferase YghU  71.03 
 
 
292 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.235045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5157  Glutathione S-transferase domain  74.11 
 
 
292 aa  434  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2694  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.99 
 
 
288 aa  431  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2933  putative glutathione S-transferase YghU  73.21 
 
 
280 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2758  putative glutathione S-transferase YghU  73.12 
 
 
280 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2839  putative glutathione S-transferase YghU  72.86 
 
 
279 aa  424  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.635211  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2223  putative glutathione S-transferase YghU  73.21 
 
 
279 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000701871  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3394  putative glutathione S-transferase YghU  68.28 
 
 
289 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02865  predicted S-transferase  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0707  Glutathione S-transferase domain protein  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0703  glutathione S-transferase family protein  71.79 
 
 
304 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3416  putative glutathione S-transferase YghU  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4301  putative glutathione S-transferase YghU  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02814  hypothetical protein  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3456  putative glutathione S-transferase YghU  69.23 
 
 
288 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3867  putative glutathione S-transferase YghU  71.33 
 
 
286 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.246613 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0704  putative glutathione S-transferase YghU  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3169  putative glutathione S-transferase YghU  69.23 
 
 
288 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3078  putative glutathione S-transferase YghU  72.4 
 
 
279 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3275  putative glutathione S-transferase YghU  69.58 
 
 
288 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0609  putative glutathione S-transferase YghU  71.07 
 
 
280 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410301 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0793  putative glutathione S-transferase YghU  70.42 
 
 
286 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06431  putative glutathione S-transferase YghU  70.11 
 
 
286 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3312  putative glutathione S-transferase YghU  65.88 
 
 
298 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.107289  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3322  putative glutathione S-transferase YghU  68.53 
 
 
288 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.672538  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3393  putative glutathione S-transferase YghU  68.18 
 
 
288 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0613255  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3487  putative glutathione S-transferase YghU  68.18 
 
 
288 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.746399  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3387  putative glutathione S-transferase YghU  68.18 
 
 
288 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453629 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000596  glutathione S-transferase  71.89 
 
 
285 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000418162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3313  putative glutathione S-transferase YghU  68.18 
 
 
288 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3680  putative glutathione S-transferase YghU  65.36 
 
 
282 aa  408  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1453  putative glutathione S-transferase YghU  70.61 
 
 
279 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0361981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1842  putative glutathione S-transferase YghU  70.25 
 
 
279 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3468  putative glutathione S-transferase YghU  68.09 
 
 
290 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3971  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.36 
 
 
279 aa  402  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.503706  normal  0.0610205 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2902  putative glutathione S-transferase YghU  67.62 
 
 
285 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3240  putative glutathione S-transferase YghU  67.97 
 
 
285 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2458  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.09 
 
 
286 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000298304 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00519  putative Glutathione S-transferase  64.87 
 
 
285 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3914  putative glutathione S-transferase YghU  68 
 
 
285 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2595  putative glutathione S-transferase YghU  63.73 
 
 
288 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0635  putative glutathione S-transferase YghU  65.23 
 
 
289 aa  381  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2217  putative glutathione S-transferase YghU  68 
 
 
289 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1225  putative glutathione S-transferase YghU  65 
 
 
284 aa  368  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0370  putative glutathione S-transferase YghU  64.77 
 
 
283 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2143  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.36 
 
 
289 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0437  putative glutathione S-transferase YghU  64.64 
 
 
284 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16982  predicted protein  62.11 
 
 
290 aa  355  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.721478  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1381  putative glutathione S-transferase YghU  66.93 
 
 
280 aa  350  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231863  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1080  putative glutathione S-transferase YghU  66.93 
 
 
280 aa  346  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1146  putative glutathione S-transferase YghU  59.14 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.137418  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0790  putative glutathione S-transferase YghU  58.57 
 
 
262 aa  286  2e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000188448  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 
230 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1988  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.93 
 
 
233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.601516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3866  Glutathione S-transferase domain  45.15 
 
 
229 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2145  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.13 
 
 
230 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0715733  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2178  Glutathione S-transferase domain  47.89 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5556  glutathione S-transferase-like protein  48.13 
 
 
230 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1366  Glutathione S-transferase domain  45.62 
 
 
233 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202985  hitchhiker  0.00146778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2266  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
230 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1855  Glutathione S-transferase domain protein  46.48 
 
 
230 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  0.146027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2228  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1616  glutathione S-transferase-like  47.66 
 
 
230 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2021  putative GST-related protein  45.06 
 
 
230 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398836  normal  0.122618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1001  glutathione S-transferase  46.26 
 
 
230 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02807  glutathione S-transferase  44.17 
 
 
229 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2252  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.73 
 
 
230 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.791972  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0300  glutathione S-transferase-like protein  40.65 
 
 
234 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3457  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.02 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0220469  normal  0.0243961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0131  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.95 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.949199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0967  glutathione S-transferase-like protein  43.86 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00253605  normal  0.0380102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1954  putative GST-related protein  45.09 
 
 
255 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0078  Glutathione S-transferase domain  43.93 
 
 
235 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0751  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.05 
 
 
242 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0134442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3152  glutathione S-transferase-like  43.42 
 
 
235 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.194724  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3771  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.7 
 
 
230 aa  171  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.680155  normal  0.387546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4693  glutathione S-transferase-like protein  45.12 
 
 
232 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>