More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0748 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0748  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.206898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  34.48 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3483  maleylacetoacetate isomerase  37.5 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.746839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  35.98 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  35.37 
 
 		 210 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  34.13 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2452  maleylacetoacetate isomerase  29.94 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  34.76 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  34.34 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0055  maleylacetoacetate isomerase  30.9 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  34.34 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  31.14 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1448  maleylacetoacetate isomerase  28.33 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0734  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3268  maleylacetoacetate isomerase  33.71 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.230799 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2523  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2322  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2366  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2411  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  30.95 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  32.93 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2415  maleylacetoacetate isomerase  30.89 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.540262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3700  maleylacetoacetate isomerase  30.17 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.207299 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  30.72 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  31.65 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1488  maleylacetoacetate isomerase  31.07 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0249985  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2431  maleylacetoacetate isomerase  32.02 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  31.14 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1519  maleylacetoacetate isomerase  31.07 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.530215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1483  maleylacetoacetate isomerase  31.07 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0333426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3058  maleylacetoacetate isomerase  29.49 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2728  maleylacetoacetate isomerase  31.36 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.812162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1390  maleylacetoacetate isomerase  29.94 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0482  maleylacetoacetate isomerase  29.71 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1332  maleylacetoacetate isomerase  29.94 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00362788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2870  maleylacetoacetate isomerase  31.36 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.639949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2777  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.58778  hitchhiker  0.0000623872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1513  maleylacetoacetate isomerase  32.35 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.04135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2821  maleylacetoacetate isomerase  30.54 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1376  maleylacetoacetate isomerase  31.48 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2196  maleylacetoacetate isomerase  30.54 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2810  maleylacetoacetate isomerase  30.54 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.148733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3331  maleylacetoacetate isomerase  33.53 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0071  maleylacetoacetate isomerase  30.81 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3147  maleylacetoacetate isomerase  29.34 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1671  glutathione S-transferase family protein  29.89 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3128  maleylacetoacetate isomerase  28.99 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2921  maleylacetoacetate isomerase  28.99 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6140  maleylacetoacetate isomerase  30.54 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0097  maleylacetoacetate isomerase  28.99 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1492  maleylacetoacetate isomerase  28.99 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1699  maleylacetoacetate isomerase  31.85 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0280  maleylacetoacetate isomerase  34.56 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.676121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2603  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00128828  hitchhiker  0.00000038371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2670  maleylacetoacetate isomerase  29.55 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0314293  normal  0.0122257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0744  maleylacetoacetate isomerase  28.4 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0560  maleylacetoacetate isomerase  28.99 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0590081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2591  maleylacetoacetate isomerase  28.98 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000826527  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2864  maleylacetoacetate isomerase  30.51 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.106686  hitchhiker  0.0000000000452605 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2234  hypothetical protein  29.65 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4581  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0575  maleylacetoacetate isomerase  28.4 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.210022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1452  maleylacetoacetate isomerase  30.11 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0240  maleylacetoacetate isomerase  29.34 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3352  maleylacetoacetate isomerase  34.55 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0261  maleylacetoacetate isomerase  29.34 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  29.31 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2736  maleylacetoacetate isomerase  30.06 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1561  maleylacetoacetate isomerase  26.95 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0491  maleylacetoacetate isomerase  29.94 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.553787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.21 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2206  hypothetical protein  29.7 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0333  maleylacetoacetate isomerase  32.54 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0465  maleylacetoacetate isomerase  27.22 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3570  maleylacetoacetate isomerase  34.09 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.809347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  32.5 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0307  maleylacetoacetate isomerase  34.75 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3502  maleylacetoacetate isomerase  33.16 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3421  maleylacetoacetate isomerase  34.09 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.132965  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2048  maleylacetoacetate isomerase  30.23 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.424671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3583  maleylacetoacetate isomerase  27.81 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  32.94 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1046  maleylacetoacetate isomerase  32.34 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4141  maleylacetoacetate isomerase  29.44 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2926  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02826  maleylacetoacetate isomerase  27.68 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4733  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.77 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2136  maleylacetoacetate isomerase  30.77 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2272  maleylacetoacetate isomerase  36.11 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0111358  normal  0.280223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5085  maleylacetoacetate isomerase  29.63 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2723  maleylacetoacetate isomerase  31.14 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.716083  normal  0.0759562 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  31.1 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0577  maleylacetoacetate isomerase  28.33 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495555  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1440  maleylacetoacetate isomerase  33.04 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  28.14 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50200  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  30.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2807  maleylacetoacetate isomerase  30.72 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000173489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  28.4 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0991  maleylacetoacetate isomerase  26.58 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000221675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>