More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0467 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  47.64 
 
 
222 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  45.91 
 
 
226 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  45.5 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  43.38 
 
 
227 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  43.24 
 
 
226 aa  175  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  41.4 
 
 
221 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
225 aa  164  9e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  40.65 
 
 
225 aa  161  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.64 
 
 
229 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.62 
 
 
238 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.53 
 
 
227 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  42.86 
 
 
224 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  37.79 
 
 
224 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  39.91 
 
 
224 aa  147  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  44.67 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.46 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  39.29 
 
 
232 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  29.8 
 
 
234 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  36.42 
 
 
237 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  33.94 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  33.94 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  33.33 
 
 
203 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
203 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  33.33 
 
 
203 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  33.84 
 
 
221 aa  92  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  32.72 
 
 
203 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
203 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  32.72 
 
 
203 aa  91.7  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.1 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  32.72 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  32.72 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.72 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  32.72 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  31.87 
 
 
199 aa  89.4  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  32.1 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
203 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  31.48 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
203 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  31.87 
 
 
198 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.69 
 
 
203 aa  88.2  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  32.69 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
203 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  32.47 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  35.15 
 
 
223 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  31.48 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  32.08 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  32.05 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  33.93 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  32.1 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  31.49 
 
 
220 aa  78.2  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  31.49 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  32.74 
 
 
208 aa  77  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  29.94 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.1 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.1 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  32.1 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  30.82 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  31.61 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  31.61 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  33.12 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  31.29 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  29.63 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  29.8 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.25 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3698  stringent starvation protein A  32.48 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.269325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>