More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1854 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
227 aa  467  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  52.05 
 
 
226 aa  234  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  50.68 
 
 
223 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  49.09 
 
 
226 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  47.32 
 
 
227 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  48.84 
 
 
224 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  45.7 
 
 
224 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.07 
 
 
238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.6 
 
 
229 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  43.72 
 
 
224 aa  205  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.4 
 
 
225 aa  205  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.86 
 
 
226 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  46.58 
 
 
225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  39.53 
 
 
218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  39.53 
 
 
218 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  40.55 
 
 
222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  37.62 
 
 
221 aa  135  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  35.43 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  33.18 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.48 
 
 
237 aa  102  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  33.5 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  33.54 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  33.54 
 
 
203 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  29.11 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.95 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  33.95 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  33.95 
 
 
203 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  33.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  32.93 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  28.45 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.57 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  33.95 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  33.95 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  32.02 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  33.95 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  32.32 
 
 
203 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  30.58 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  30.26 
 
 
289 aa  77  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  32.1 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  31.79 
 
 
237 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.1 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  29.38 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  32.1 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27755  glutathione S-transferase  28.06 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.102414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0899  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.717795  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00805  predicted glutathione S-transferase  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2804  Glutathione S-transferase domain protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0990  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.472621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2804  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0864  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  31.29 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0908  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00822  hypothetical protein  30.99 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2508  glutathione S-transferase family protein  30.99 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.122319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.48 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.29 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  25.83 
 
 
427 aa  75.1  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  27.49 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  31.48 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  27.59 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0934  glutathione S-transferase family protein  30.59 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  28.75 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  30.63 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  27.05 
 
 
206 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  26.96 
 
 
204 aa  72  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  28.08 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0898  glutathione S-transferase family protein  29.41 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  28.64 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1014  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0683472  normal  0.818596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.48 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0995  glutathione S-transferase family protein  30 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.80831  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  28 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  27.14 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1049  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.98 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104834  normal  0.267684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  28.57 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  27.45 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  27.4 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3556  Glutathione S-transferase domain protein  28.25 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  23.98 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  27.45 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0966  glutathione S-transferase family protein  29.41 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>