More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2760 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 215 aa  441  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  29.91 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  29.9 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.95 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  25.88 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.94 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.14 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  26.95 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.79 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  33.98 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.86 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.32 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3554  maleylacetoacetate isomerase  34.26 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.469077  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0523  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.4 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  34 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  29.63 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1350  Glutathione S-transferase domain protein  26.79 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.94 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  43.01 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.55 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4250  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.03 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1764  Glutathione S-transferase domain  29.65 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2965  Glutathione S-transferase domain protein  42.55 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0279406  normal  0.0713112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0912  maleylacetoacetate isomerase  36.7 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  29.01 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  26.7 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1378  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1394  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.86 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.12 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  28.39 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3282  maleylacetoacetate isomerase  34.26 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318368  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1051  glutathione S-transferase-like protein  37.36 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00110623  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0854  maleylacetoacetate isomerase  37.04 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3672  maleylacetoacetate isomerase  36.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  30.54 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0711  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.349527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1158  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0670265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1464  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.123939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0441  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.66 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.743701  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1327  glutathione S-transferase family protein  33.66 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38550  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000321346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.84 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  34.26 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.24 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3434  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.78 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.398692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  26.24 
 
 		 294 aa  55.5  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  31.96 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1318  glutathione S-transferase family protein  28.74 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  27.83 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0907  putative glutathione S-transferase  28.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.58191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.96 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  26.53 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  25.47 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1011  gst-related protein  29.53 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.79 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  29.24 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0819  maleylacetoacetate isomerase  34.91 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3984  glutathione S-transferase-like  24.5 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.10217  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.79 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1802  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.48 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  32.67 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3563  maleylacetoacetate isomerase  37.89 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0739  maleylacetoacetate isomerase  37.74 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0180074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  32.92 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0422  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.13 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.850125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.1 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.09 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  32.67 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  36.54 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26.19 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  28.92 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  29.41 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3711  glutathione S-transferase-like  27.38 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3536  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.04 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3821  maleylacetoacetate isomerase  26.52 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.101505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4603  maleylacetoacetate isomerase  33.02 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0833073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  29.41 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3950  glutathione S-transferase-like protein  27.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259854  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.24 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3335  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  33.67 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  28.91 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2218  maleylacetoacetate isomerase  37.37 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  30.97 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  31.9 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  27.5 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.51 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  27.01 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>