More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0647 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  38.16 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  30.19 
 
 
215 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  34.29 
 
 
219 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  29.72 
 
 
294 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 
215 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  32.85 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.47 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  33.49 
 
 
391 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  31.4 
 
 
217 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  32.69 
 
 
246 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.21 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  32.21 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  30.81 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  30.81 
 
 
219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  30.33 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.52 
 
 
248 aa  85.1  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  28.38 
 
 
303 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.73 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  27.05 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  27.48 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  28.99 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  30.77 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  30.43 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  31.35 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  30.22 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  31.35 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.72 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.58 
 
 
219 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.1 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  29.65 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  27.65 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.77 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.77 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  27.1 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5490  glutathione S-transferase-like protein  26.79 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.77 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  25.23 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  25.86 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  24.88 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  24.88 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  25.23 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3824  glutathione S-transferase-like  26.09 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.136134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.83 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.88 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  23.83 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.72 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  24.3 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  25.12 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.05 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  24.4 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.9 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  27.44 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  25.6 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  25.6 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  23.56 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.94 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  26.89 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0208  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.48 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.902366  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  26.89 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.37 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.9 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  24.84 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2167  putative GST-related protein  26.64 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0415103  normal  0.0855354 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.9 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  22.97 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  22.9 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  30.95 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.35 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4404  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.43 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.213346 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  26.35 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.35 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>