More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1953 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  54.71 
 
 		 228 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  55.61 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.54 
 
 		 215 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  53.27 
 
 		 391 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  49.53 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  49.53 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 219 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  49.07 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  47.2 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  50 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.53 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 303 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  47.66 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 303 aa  184  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  47.2 
 
 		 219 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  46.73 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  46.23 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  47.66 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.75 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  46.23 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.46 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.79 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.46 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  41.67 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  38.94 
 
 		 211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  36.62 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  32.16 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  31.21 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  32.74 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.21 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.9 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.61 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.64 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.21 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.24 
 
 		 215 aa  99  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.41 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  33.96 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.85 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  32.54 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  34.48 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.46 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  28.08 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  36.97 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.46 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2208  glutathione S-transferase  32.86 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.46 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0754  stringent starvation protein A  28.64 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00653635  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.71 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  31.13 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  28 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  30.81 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.64 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  28.64 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  29.95 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  25.96 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  32.16 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.49 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.3 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  26.51 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  27.36 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  27.36 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  26.17 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  28.8 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  26.98 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  29.07 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  28.78 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0906  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0916271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5000  stringent starvation protein A  30.1 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0261594  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4689  glutathione S-transferase-like protein  29.56 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.111203  normal  0.0217381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  28.29 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  27.55 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  23.47 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  29.13 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.13 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  29.67 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  29.11 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.76 
 
 		 225 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  23.47 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  27.23 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  28.16 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1843  Glutathione S-transferase domain protein  29.88 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00779491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.77 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>