More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3933 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  99.53 
 
 
215 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  95.35 
 
 
215 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  90.7 
 
 
215 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  82.33 
 
 
215 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  82.33 
 
 
215 aa  374  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  81.4 
 
 
215 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.4 
 
 
215 aa  370  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.93 
 
 
215 aa  367  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.45 
 
 
217 aa  251  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.88 
 
 
215 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 
216 aa  236  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  58.53 
 
 
217 aa  235  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  46 
 
 
233 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  36.45 
 
 
228 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  38.01 
 
 
391 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  39.05 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.5 
 
 
215 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.71 
 
 
217 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  31 
 
 
211 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 
224 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  34.12 
 
 
219 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.85 
 
 
248 aa  98.6  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  34.12 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  31.76 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  29.85 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  31.18 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  34.48 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.74 
 
 
219 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  28.57 
 
 
219 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.14 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  32.14 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.91 
 
 
226 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.54 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.55 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  35.47 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  30.46 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  30.46 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  32.93 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.82 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  28.65 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  32.32 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.51 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  28.12 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.94 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  29.61 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  29.65 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0885  glutathione S-transferase  29.65 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0233753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  29.57 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  27.78 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28.5 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  29.15 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  29.15 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4479  maleylacetoacetate isomerase  32.62 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.28654  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4619  maleylacetoacetate isomerase  32.62 
 
 
210 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  30.1 
 
 
227 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  26.63 
 
 
202 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  28.32 
 
 
210 aa  58.9  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  27.93 
 
 
260 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0409  Glutathione S-transferase domain protein  29.09 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  26.4 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  24.73 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.88 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  26.63 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26.04 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  28.74 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.27 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  27.54 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  28.74 
 
 
203 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  26.32 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  26.67 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  27.55 
 
 
226 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  30.41 
 
 
203 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.32 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.41 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  30.41 
 
 
203 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>