More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3548 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.53 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.45 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.53 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 		 215 aa  255  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  55.76 
 
 		 215 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 		 215 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.76 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  56.22 
 
 		 215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 216 aa  228  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.67 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 233 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  35.61 
 
 		 211 aa  124  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  39.18 
 
 		 391 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  34.12 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  34.98 
 
 		 228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.11 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.95 
 
 		 219 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 246 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.9 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  33.64 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.64 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  33.64 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.24 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  39.18 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.39 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  32.84 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  33.92 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  37.21 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.06 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  30.39 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  32.34 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  32.34 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  29.61 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  29.61 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  31.74 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  31.74 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  33.33 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  29.45 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  31.1 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  25.98 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.91 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.51 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  28.29 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  27.61 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  28.22 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  26.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  26.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  26.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.61 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  30.86 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  27.96 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  28 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  26.57 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  26.98 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  30.57 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  26.57 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  26.22 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2695  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2865  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2483  glutathione S-transferase-like protein  25.74 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.478501  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  25.11 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  29.61 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  25.61 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  32.46 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  27.61 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  25.59 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  29.3 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  29.3 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  29.94 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.94 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  28.44 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  28.05 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3618  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.36 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  27.61 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.66 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1417  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.15 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.22 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  30.68 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  25.15 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.15 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1132  glutathione S-transferase family protein  27.17 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  26.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>