More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3110 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.62 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  59.91 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.29 
 
 		 217 aa  262  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.63 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  59.17 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.17 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  58.99 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  59.17 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.53 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  56.94 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  55.3 
 
 		 219 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  56.22 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  53 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  53 
 
 		 219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  53 
 
 		 303 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  53 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  53 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  52.53 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  53 
 
 		 217 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.24 
 
 		 228 aa  216  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.54 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 		 217 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  45.37 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.47 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  49.33 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  45.28 
 
 		 391 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  44.13 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.23 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  43.4 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  42.4 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  43.96 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.71 
 
 		 215 aa  101  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  33.92 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.06 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.06 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  32.94 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.48 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.76 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  33.53 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.58 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.33 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.54 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.22 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  28.71 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.82 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1560  glutathione S-transferase-like  25.37 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25247  normal  0.599029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.34 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.45 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  28.24 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  28.7 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.45 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  26.7 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  28.77 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  30 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.34 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4930  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.25 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.73 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.13 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  31.6 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  26.13 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.04 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  28.37 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  32.17 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  26.14 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  27.1 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  27.5 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  29.5 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  27.59 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.74 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  28.1 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.9 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  26.51 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.5 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2967  glutathione S-transferase-like protein  30.3 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  28.04 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1002  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3675  glutathione S-transferase-like protein  27.4 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1171  Glutathione S-transferase domain protein  29.33 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4241  glutathione S-transferase-like  27.75 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  32.5 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.41 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0239  glutathione S-transferase-like protein  29.25 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.361263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  24.43 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  24.43 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  24.43 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2344  glutathione S-transferase  28.22 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4773  glutathione S-transferase-like  30.97 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>