More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2818 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  75.34 
 
 
219 aa  341  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  54.88 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.6 
 
 
219 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.6 
 
 
219 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  52.97 
 
 
219 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  52.97 
 
 
219 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  52.97 
 
 
303 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.14 
 
 
248 aa  218  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  52.97 
 
 
303 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  52.97 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  52.97 
 
 
219 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
219 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
219 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  49.32 
 
 
219 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  49.77 
 
 
219 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  50.7 
 
 
219 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  49.54 
 
 
219 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  51.14 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  50.68 
 
 
219 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.77 
 
 
217 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 
226 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  45.37 
 
 
218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  45.37 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  48.39 
 
 
220 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.05 
 
 
217 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.7 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
224 aa  165  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.63 
 
 
217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  44.86 
 
 
391 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  40.48 
 
 
228 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  42.38 
 
 
228 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  35.75 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  28.24 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.99 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.82 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.59 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  34.63 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
215 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.01 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  27.22 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  25 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  26.95 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.9 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  34.13 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  23.04 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  26.92 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  23.74 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  29.47 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.65 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  27.62 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  24.24 
 
 
241 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  22.55 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.95 
 
 
210 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  24.4 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  29.56 
 
 
261 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  25.93 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  27.14 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  25.93 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  28.36 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  23.86 
 
 
202 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  28.17 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.17 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  26.39 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.76 
 
 
202 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3482  glutathione S-transferase domain protein  31.55 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  24.19 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.22 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  23.86 
 
 
202 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.81 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  25.39 
 
 
199 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  28.17 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.11 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2012  gst-related protein  25 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.844191  normal  0.0196648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  26.37 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.44 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2091  glutathione S-transferase-like  23.47 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00729429  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  23.79 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3546  Glutathione S-transferase domain protein  31.07 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  23.32 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  26.37 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.37 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  23.79 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3464  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.85 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.774951  normal  0.0546262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  27.22 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  30.43 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  25.56 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>