More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3702 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.3 
 
 		 229 aa  325  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  69.27 
 
 		 226 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  69.27 
 
 		 227 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  71.1 
 
 		 223 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  54.95 
 
 		 224 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  59.91 
 
 		 225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  51.34 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  51.8 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.67 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.25 
 
 		 226 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.05 
 
 		 227 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.93 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  43.24 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  43.24 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  40.27 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  41.67 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  32.13 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  37.62 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  30.48 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  31.88 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  34.47 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.36 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  32.37 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  32.32 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  32.32 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  31.71 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.32 
 
 		 203 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  31.1 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  31.1 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 203 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  31.71 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  31.1 
 
 		 203 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  31.68 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  32.5 
 
 		 221 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  31.1 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  31.1 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.1 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  30.49 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  28.7 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.49 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  29.24 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  30.49 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  29.01 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  29.88 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.88 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  31.01 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  31.19 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.27 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  32.99 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  29.81 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  32.53 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.12 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.64 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  34.68 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.27 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  29.88 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.49 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7686  glutathione S-transferase-like protein  30.61 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.474064  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  28.92 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1699  glutathione S-transferase family protein  32.16 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  32.21 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  34.64 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  27.91 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5166  Glutathione S-transferase domain protein  28.83 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1577  glutathione S-transferase family protein  31.22 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  33.73 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  32.57 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2763  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.86 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  31.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2508  glutathione S-transferase family protein  29.44 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.122319  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  31.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  31.87 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  32.95 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  31.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  28.44 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>