More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3979 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3979  glucose-inhibited division protein A subfamily protein  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0291  glutathione S-transferase family protein  39.29 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0467  Glutathione S-transferase domain  39.29 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.336613  hitchhiker  0.000569408 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  36.99 
 
 		 224 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  36.53 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.44 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1854  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.43 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255739 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.24 
 
 		 226 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  44.94 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  36.41 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  34.23 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  33.63 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  33.04 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.78 
 
 		 238 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3702  Glutathione S-transferase domain protein  32.13 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1309  glutathione S-transferase-like protein  41.25 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00711135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.97 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2049  Glutathione S-transferase domain protein  42.77 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.631712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  30.88 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.05 
 
 		 237 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  30.7 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 203 aa  85.1  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  30.7 
 
 		 203 aa  85.1  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  31.63 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  37.5 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  31.63 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  29.77 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  30.7 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  30.7 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  34.34 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  29.77 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  30.7 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  30.7 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.23 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  29.77 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  34.88 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  33.54 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  30.95 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  29.77 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  34.57 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0296  glutathione S-transferase-like protein  31.28 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351442  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  30.7 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  32.22 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  29.72 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1830  stringent starvation protein a  30.2 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.855376  normal  0.188895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  33.94 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  31.36 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  30.34 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1739  glutathione S-transferase-like protein  29.08 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2205  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.213168  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1959  stringent starvation protein A  30 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0221  stringent starvation protein A  37.37 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0398  Glutathione S-transferase domain  37.37 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165939  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  28.83 
 
 		 407 aa  61.6  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3430  putative glutathione S-transferase  29.86 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000029866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0752  Glutathione S-transferase domain protein  31.52 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.151095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3160  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase C subunit  28.57 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.571951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  31.41 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4437  stringent starvation protein A  29.34 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.112115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0557  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.07 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  30.77 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1522  Glutathione S-transferase domain protein  27.36 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57530  stringent starvation protein A  27.84 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2329  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.73 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00249355  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2398  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.3 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211782  normal  0.0736729 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  30 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  32.12 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  32.12 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4424  stringent starvation protein A  30.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.339627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4118  glutathione S-transferase  30.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  29.78 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  28.82 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03299  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00590)  33.33 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.428749 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  31.4 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  31.4 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>