243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1905 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1905  glutathione S-transferase family protein  100 
 
 
255 aa  526  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.225069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1668  glutathione S-transferase family protein  78.82 
 
 
255 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  27.46 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3071  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.5 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.44 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5414  putative glutathione S-transferase  25.08 
 
 
349 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  26.14 
 
 
225 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5409  Glutathione S-transferase domain  24.8 
 
 
214 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1740  Glutathione S-transferase domain protein  39.78 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.47 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0197  Glutathione S-transferase domain protein  24.18 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.17 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2873  glutathione S-transferase-like  26.74 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.480428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.33 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.52 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5979  hypothetical protein  24.45 
 
 
347 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  25.52 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.21 
 
 
226 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  24.89 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  24.69 
 
 
202 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  24.89 
 
 
221 aa  56.2  0.0000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0178  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.69 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1883  glutathione S-transferase  34.12 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  28.47 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5317  glutathione S-transferase  25.52 
 
 
196 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.614599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5325  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.04 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517428  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  30.23 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1872  glutathione S-transferase  34.12 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0903  Glutathione S-transferase domain protein  23.24 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.600901  normal  0.429036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  24.8 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  25.53 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  22.69 
 
 
204 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0787  Glutathione S-transferase domain  23.97 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  30.23 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.69 
 
 
222 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4125  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.65 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.23 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  24.9 
 
 
210 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  25.63 
 
 
221 aa  53.1  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  23.95 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  32.23 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  23.29 
 
 
227 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5352  Glutathione S-transferase domain  38.04 
 
 
214 aa  52  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  23.08 
 
 
225 aa  52  0.000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4867  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.04 
 
 
214 aa  52  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1883  glutathionine S-transferase  32.56 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1775  glutathionine S-transferase  32.56 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2860  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.26 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  23.11 
 
 
222 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.18 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2552  glutathionine S-transferase  32.56 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183983  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  23.39 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  32.18 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  33.02 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2997  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.26 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895357  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3102  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.93 
 
 
205 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.323994 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 
201 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2945  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 
212 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.18 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1564  glutathionine S-transferase  25.49 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.98 
 
 
230 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  25.71 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  24.7 
 
 
223 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5328  Glutathione S-transferase domain  23.83 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0310623  normal  0.952299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  30.38 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3104  Glutathione S-transferase domain protein  22.93 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.21 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2865  glutathione S-transferase-like  25.6 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0706359  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1437  maleylacetoacetate isomerase  35.45 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.979094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  22.44 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5735  Glutathione S-transferase domain protein  25.41 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  23.43 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  22.98 
 
 
230 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  32.67 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4837  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.22 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  23.01 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  28.79 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4683  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
214 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  23.79 
 
 
230 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  21.9 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2946  glutathione S-transferase-like  21.28 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  hitchhiker  0.0000427807 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  38.2 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2337  glutathione S-transferase-like  32.26 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0459494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  36.84 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2951  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.26 
 
 
212 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.51 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  22.22 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  42.42 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  22.27 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.17 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  24.29 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.11 
 
 
205 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.59 
 
 
202 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0384  maleylacetoacetate isomerase (glutathione transferase zeta 1) protein  31.03 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1688  Glutathione S-transferase domain protein  21.29 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.423888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0872  glutathione S-transferase-like  32.08 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2762  maleylacetoacetate isomerase  33.33 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  24.65 
 
 
210 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2972  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.18 
 
 
212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.435307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0029  putative glutathione S-transferase  23.9 
 
 
209 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0588223  normal  0.184572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>