More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1911 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1991  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  54.73 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2166  Glutathione S-transferase domain protein  53.73 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.193029  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.75 
 
 		 213 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.381422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  57.75 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4505  Glutathione S-transferase domain  59.04 
 
 		 213 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542768  normal  0.527562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  51.92 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0253  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.08 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.617633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0995  glutathione S-transferase domain-containing protein  52 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0897  glutathione S-transferase  54.45 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2556  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.45 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.51 
 
 		 211 aa  210  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.22 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2889  glutathione S-transferase-like  43.69 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.737778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5702  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.366134  normal  0.106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  39.29 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1699  Glutathione S-transferase domain protein  42.93 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4826  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.39 
 
 		 211 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3512  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0031  glutathione S-transferase  39.59 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3695  Glutathione S-transferase domain  39.09 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0434501  hitchhiker  0.00000154046 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1358  Glutathione S-transferase domain  39.81 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.462445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.79 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0065  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.55 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0039  glutathione S-transferase-like  40.4 
 
 		 198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1689  glutathione S-transferase-like  36.36 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2508  Glutathione S-transferase domain  38.61 
 
 		 214 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0524  Glutathione S-transferase domain protein  35.75 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3382  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.89 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0537  Glutathione S-transferase domain  35.71 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5220  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.89 
 
 		 219 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0962693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2964  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.95 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6685  glutathione S-transferase  36.84 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  36.92 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  37.95 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.95 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0607  putative glutathione S-transferase protein  33.96 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.9 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3564  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.146055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2990  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2853  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.606213 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0145  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.67 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.397548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0144  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4186  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.05 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.68 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  29.21 
 
 		 202 aa  89  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.35 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  29.32 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  29.32 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  28.12 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  30.32 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.13 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2600  glutathione S-transferase  32.85 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.465574 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  29.08 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  29.08 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0907  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.21 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2002  glutathione S-transferase-like protein  31.47 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  30.95 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2823  glutathione S-transferase  35.15 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0457673  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2947  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.29 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2020  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.83 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.62 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2251  Glutathione transferase  31.79 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3181  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  29.9 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  30.05 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  27.05 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  28.23 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0670  putative glutathione S-transferase (GST)  27.8 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  0.0458182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2859  Glutathione S-transferase domain protein  31.22 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2628  Glutathione S-transferase domain  30.62 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  27.55 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0838  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.98 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0531264  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.65 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3561  Glutathione S-transferase domain protein  28.65 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134068  normal  0.24035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  31.82 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5300  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.217524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0571  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.84 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.382264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4165  glutathione S-transferase-like  29.76 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  29.86 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3478  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.556825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  30.53 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2968  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.83 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5977  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.57 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.1 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  28.16 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  27.64 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  28.5 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  28.87 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0407  glutathione S-transferase  29.35 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.73 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>