246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0439 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0439  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 230 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0171  glutathione S-transferase-like  90 
 
 		 230 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0044  Glutathione S-transferase domain  87.39 
 
 		 230 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0662  glutathione S-transferase-like protein  87.39 
 
 		 230 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.165169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0185  glutathione S-transferase-like  82.17 
 
 		 230 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0164  glutathione S-transferase  81.3 
 
 		 230 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0222  putative glutathione S-transferase family protein  82.17 
 
 		 230 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1808  glutathione S-transferase domain-containing protein  61.74 
 
 		 280 aa  292  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0584047  normal  0.113332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.61 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  62.61 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3313  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.17 
 
 		 229 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.03107  normal  0.604378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  61.74 
 
 		 230 aa  284  9e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  60 
 
 		 230 aa  279  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  62.61 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5423  Glutathione S-transferase domain protein  61.74 
 
 		 230 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.361864  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3681  Glutathione S-transferase domain protein  56.52 
 
 		 230 aa  260  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4583  Glutathione S-transferase domain protein  50.87 
 
 		 230 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4320  Glutathione S-transferase domain  50.43 
 
 		 230 aa  238  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1338  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.48 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1044  glutathione S-transferase family protein  53.48 
 
 		 230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0982  glutathione S-transferase family protein  53.48 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3535  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.17 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0341  glutathione S-transferase  50.87 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1050  glutathione S-transferase  49.13 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.087398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3599  glutathione S-transferase-like  56.09 
 
 		 229 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  49.57 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0199  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.57 
 
 		 226 aa  212  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0022  glutathione S-transferase-like protein  49.78 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.428941  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  43.72 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.29 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1977  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.35 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290176  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.42 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  40.87 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  40.87 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  41.99 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  42.53 
 
 		 241 aa  179  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0117  glutathione S-transferase-like protein  46.58 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.851725  normal  0.725895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4722  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.88 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.247027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.54 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3080  glutathione S-transferase-like  40.87 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4945  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.97 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_002978  WD1058  glutathione S-transferase family protein  34.8 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0241  glutathione S- transferase, N-terminal  33.04 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0847  glutathione S-transferase family protein  32.17 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.33451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27580  putative glutathione S-transferase  31.16 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.08808  decreased coverage  0.00115097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2334  glutathione S-transferase  30.33 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0381359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2123  glutathione S-transferase-like protein  27.73 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.91 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  26 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  25 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  29.03 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1069  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.52 
 
 		 203 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  24.64 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.4 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0062  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.36 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  23.92 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  25.5 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  23.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.36 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  23.44 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.4 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  28.17 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  24.88 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.32 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5332  Glutathione S-transferase domain  25.57 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  25.79 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1668  glutathione S-transferase family protein  24.9 
 
 		 255 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1064  Glutathione S-transferase domain  30.23 
 
 		 210 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00553771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.44 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  23.92 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  28.11 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.86 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.02 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  27.05 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  29.63 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0797  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.66 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  27.44 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  23.92 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  23.92 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  27.1 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  23.44 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1824  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.61 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.44 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4194  glutathione S-transferase  26.86 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0822  Glutathione S-transferase domain protein  27.86 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.91 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0319  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.8 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  22.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>