More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5691 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_5691  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7480  glutathione S-transferase-like protein  84.55 
 
 
220 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1744  Glutathione S-transferase domain protein  58.99 
 
 
221 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  32.34 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  30.81 
 
 
223 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2474  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  42.06 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1651  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.65 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.491053  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1914  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.86 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0652856  normal  0.568324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  30.97 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3532  Glutathione S-transferase domain protein  27.03 
 
 
217 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.150118 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1437  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.92 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000241692  hitchhiker  0.000981469 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3795  stringent starvation protein A  31.14 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00599595  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3332  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.68 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0526  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0518789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3637  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0462  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511157  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0585  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.09 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3535  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00187434  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1071  glutathione S-transferase  33.16 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292672  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3533  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000186075  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3702  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3640  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3605  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0584302  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3524  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742741  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03089  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0477  Glutathione S-transferase domain protein  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03040  hypothetical protein  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00103064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3418  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000267382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4546  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000354095  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1132  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000177989  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0477  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000183333  normal  0.261267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3712  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3547  stringent starvation protein A  29.94 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000170112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  29.58 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2670  putative glutathione S-transferase  32.52 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0107  glutathione S-transferase  32.52 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1267  glutathione S-transferase  32.52 
 
 
214 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  27.69 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0125  glutathione S-transferase  32.52 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0291  glutathione S-transferase-like protein  26.73 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.278783  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5079  Glutathione S-transferase domain  30.81 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242731  hitchhiker  0.00740675 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  27.69 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2817  glutathione S-transferase  33.16 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  31.06 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4031  putative glutathione S-transferase  32.31 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.39864  normal  0.426189 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0301  stringent starvation protein A  29.51 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00830466  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0294  stringent starvation protein A  29.51 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0133166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  27.69 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3664  stringent starvation protein A  28.74 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0407  glutathione S-transferase  33.52 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  27.18 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  27.18 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  27.18 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0254  stringent starvation protein A  28.48 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0916387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.69 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4347  stringent starvation protein A  30.6 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000258123  hitchhiker  0.00803988 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.243795  normal  0.0957714 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1939  stringent starvation protein A  28.48 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0108  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0236194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  27.18 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  34.42 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4759  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.895544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3092  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.061874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5226  Glutathione S-transferase domain  27.55 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0430433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4617  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03200  stringent starvation protein A  28.4 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000139382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  33.18 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1329  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.21 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.630065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.52 
 
 
202 aa  63.5  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4128  glutathione S-transferase-like  30.67 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3304  stringent starvation protein A  30.18 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5301  Glutathione S-transferase domain  26.87 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  29.72 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  30.1 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  28.08 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  30.59 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1609  glutathione S-transferase-like protein  32.22 
 
 
216 aa  62.4  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  26.8 
 
 
199 aa  62.4  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0113  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.82 
 
 
211 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.118782  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2630  hypothetical protein  29.81 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  30.5 
 
 
232 aa  61.6  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>