38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1599 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1599  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0946501 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1078  Glutathione S-transferase domain  48.11 
 
 		 229 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1550  lignin degradation protein  46.48 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.355245  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1223  Glutathione S-transferase domain protein  46.23 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0774  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.97 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2357  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.07 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.396368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4820  Glutathione S-transferase domain  37.09 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1948  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.49 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4134  glutathione S-transferase-like  35.89 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4143  glutathione S-transferase-like protein  35.89 
 
 		 231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.595769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2618  glutathione S-transferase domain protein  35.85 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1788  putative glutathione S-transferase (GST)  34.27 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6243  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.07 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.247558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7062  Glutathione S-transferase domain protein  36.87 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  30.77 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4017  glutathione S-transferase-like  32.55 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.678212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2685  glutathione S-transferase-like protein  33.18 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3099  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.18 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.937068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05770  Glutathione S-transferase-like protein  35.38 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2405  glutathione S-transferase-like  26.61 
 
 		 279 aa  93.6  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1652  hypothetical protein  25.89 
 
 		 237 aa  88.6  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  0.0204387 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02592  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.121449  normal  0.298423 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00480  expressed protein  27.23 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  30.71 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2922  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.62 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.894063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0579  putative glutathione S-transferase  30.71 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02948  glutathione S-transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07930)  23.67 
 
 		 268 aa  48.5  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  24.73 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5058  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.19 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000892035 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2890  glutathione S-transferase-like  28.91 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3634  glutathione S-transferase domain protein  32.17 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  26.67 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24830  putative glutathione S-transferase  28.02 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  34.41 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5366  Glutathione S-transferase domain protein  35.77 
 
 		 207 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.230494  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.66 
 
 		 226 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  30.96 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>